UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés


  • 001
  • 002
  • 003
  • 004
  • 005
  • 006
  • 007
  • 008
  • 009
  • 010
  • 011
  • 012
  • 013
  • 014
  • 015
  • 016
  • 017
  • 018
  • 019
  • 020
  • 021
  • 022
  • 023
  • 024
logo LEHNA

UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes
Naturels et Anthropisés

CARIOU Marie
Post-doc. EZUS

Chercheur CDD : E3S

Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
6, rue Raphaël Dubois - Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex France

(+33) 04 72 44 82 59 (+33) 04 72 43 11 41

Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.




  • Mes recherches portent sur l’évolution des génomes à l’échelle des espèces et des populations. Ceci m’a conduit à utiliser et à développer des outils bioinformatiques permettant l’analyse de données de séquence (génomique, RADseq…).

    Actuellement, je travaille sur 2 projets impliquant ce type d’approches :

    - Résistance au jeûne alimentaire de très longue durée (18 mois) chez le protée.

    Les protées sont des amphibiens cavernicoles qui présentent une importante résistance au jeûne. J’étudie l’impact de cette adaptation au milieu souterrain sur l’expression des gènes (RNAseq) en lien avec les modification de leur métabolisme énergétique.

    - Interactions oligochètes-microorganismes.

    Les vers aquatiques tubificidés peuvent, de par leurs activités de bioturbation, stimuler les activités microbiennes dans le milieu sédimentaire (hypothèse de construction de niche). J’étudie par métabarcoding 16S les changement de communautés bactériennes associées à la présence de ces vers dans les sédiments.

  • Depuis janvier 2019 :

    Post-doctorat à Université Lyon 1 (UMR5023, LEHNA).

    2015-2018 :

    Post-doctorat à l’Université de Namur (URBE).

    Génomique des asexués anciens et études des échanges génétiques chez les rotifères bdelloides.

    2011-2015 :

    Doctorat à l’Université Lyon 1 (UMR5558, LBBE)

    Développement et utilisation de marqueurs RADseq pour l’étude de l’impact de Wolbachia sur l’évolution des mitochondries chez les Arthropodes.

    Février-juin 2011:

    Stage de master à l’Université Lyon 1 (UMR5558, LBBE)

    Estimation des pressions de sélections sur les gènes codants : le problème des contenus en base non stationnaire.

    Septembre-décembre 2010:

    Stage de master à l’Université Lyon 1 (UMR5558, LBBE)

    Wolbachia et l’introgression mitochondriale chez les Lépidoptères.

    Février-juin 2010:

    Stage de Master à l’Université de Guelph (Canada)

    Utilisation de marqueurs 28S pour le barcoding des protistes.

    Juin-juillet 2009:

    Stage au muséum national d’Histoire Naturelle.

    Systématique et adaptation au milieu profond chez les éponges du genre Oceanapia.

  • 2018

    Cariou M, Ribière C, Morlière S, Gauthier J-P, Simon J-C, Peyret P, Charlat S, 2018 - Comparing 16S rDNA amplicon sequencing and hybridization capture for pea aphid microbiota diversity analysis. BMC Research Notes, 11:461.

    2017

    Cariou M, Duret L, Charlat S, 2017 - Assessing the impact of Wolbachia on mitochondrial effective population size. Journal of Evolutionary Biology, 30:12.

    2016

    Cariou M, Duret L, Charlat S, 2016 - How and how much does RAD-seq bias genetic diversity estimates? BMC Evolutionary Biology, 16:240.

    2015

    Henri H, Cariou M, Terraz G, Martinez S, El fillali A, Veyssière M, Duret L, Charlat S, 2015 - Cost and robustness optimization for highly multiplexed RADseq libraries, Genetica, 143:139-143.

    2013

    Cariou M, Duret L, Charlat S, 2013 - Is RAD-seq suitable for phylogenetic inference? An in silico assessment and optimization, Ecology and Evolution, 3(4).

Site de la Doua
Université Claude Bernard - Lyon I
CNRS, UMR 5023 - LEHNA (Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés)
3-6, rue Raphaël Dubois - Bâtiments Darwin C & Forel, 69622 Villeurbanne Cedex
43, Boulevard du 11 novembre 1918
Plan d'accès
Tél. : (33) 4 72 43 29 53 - Fax : (33) 4 72 43 11 41
Site de Vaulx-en-Velin
ENTPE
CNRS, UMR 5023 - LEHNA (Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés)
3, rue Maurice Audin
69518 Vaulx-en-Velin
Plan d'accès
Tél : (33) 04 72 04 70 56 - Fax : (33) 04 72 04 77 43