UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés


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UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes
Naturels et Anthropisés

MERMILLOD-BLONDIN Florian
Chargé de Recherche CNRS

Chercheur : E3S
Responsable : Analyse de l'eau

Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
6, rue Raphaël Dubois - Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex FRANCE

(+33) 04 72 43 13 64 (+33) 04 72 43 15 23

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  • Principaux résultats de recherche

    Mes travaux reposent sur les concepts d’écologie fonctionnelle (notion de groupe fonctionnel, organismes ingénieurs, espèces clés de voûte, biodiversité fonctionnelle) appliqués aux interfaces eau-sédiment quelles soient marines, lacustres ou d’eau courante (zone hyporhéique). Mes recherches sont principalement issues d’expérimentations de laboratoire en microcosmes permettant de déterminer les interactions complexes entre le milieu sédimentaire, les activités des invertébrés benthiques et les processus microbiens. L’ensemble de ces travaux ont permis de démontrer que :

    1/ La bioturbation (remaniement des sédiments, création de tubes et galeries) est le processus majeur par lequel les invertébrés influencent les processus biogéochimique dans des sédiments de cours d’eau (alors que l’importance de ce processus avait été essentiellement démontrée dans des systèmes lacustres ou marins).

    2/ Le concept de groupe fonctionnel de bioturbation peut s’appliquer aux invertébrés de la zone hyporhéique, le mode de bioturbation des invertébrés déterminant leur influence sur les processus biogéochimiques (respirations, dénitrification, processus fermentaires).

    3/ Les caractéristiques physiques (granulométrie, hydrodynamisme) et chimiques (quantité et qualité de la matière organique, présence de polluants) de l’interface déterminent l’influence de la bioturbation sur les processus microbiens.

    4/ Les interactions entre invertébrés bioturbateurs ont une influence significative sur le fonctionnement de l’interface sédimentaire.

    5/ Certaines espèces bioturbatrices peuvent être considérées comme des espèces clés de voute ou fonctionnellement dominantes car leurs influences masquent le rôle des autres espèces de la communauté.

    6/ La perturbation de l’interface sédimentaire hyporhéique par des dépôts de sédiments fins modifie le rôle joué par les communautés benthiques sur les processus biogéochimiques.

    Les points (3) et (6) m’ont amené à prendre en compte la variabilité du milieu dans l’étude du rôle de la bioturbation et de la diversité des organismes ingénieurs (ou organismes bioturbateurs). Ainsi, il a été possible de démontrer que la quantification du rôle des invertébrés dans les sédiments nécessite de définir une typologie des groupes fonctionnels en fonction de grands types d’habitat (milieu stagnant ou milieu d’eau courante, matrice sédimentaire fine ou grossière, charges variables en matière organique).

    Plus récemment, des travaux menés en collaboration avec Damien Lemoine (Equipe Ecologie des Communautés Végétales) ont concerné l’étude des interactions entre des organismes ingénieurs (vers tubificidés) et des macrophytes aquatiques. Les résultats ont montré un effet positif de l’oxygénation des sédiments par les vers tubificidés sur le développement des macrophytes. Alors que les interactions vers-plantes sont largement étudiées dans les sols, ce travail est l’un des premiers à démontrer l’influence significative des organismes ingénieurs sur les végétaux aquatiques.

    Afin d’établir une quantification plus fine des processus biogéochimiques aux interfaces eau-sédiment, mes recherches actuelles intègrent l’utilisation des isotopes stables (13C, 15N) afin de suivre le devenir du carbone et de l’azote dans les systèmes sédimentaires. Cette approche est possible à travers une collaboration avec l’UMR 5125 (PEPS) de l’Université Lyon 1. L’apport des isotopes stables de l’azote et du carbone me permet aussi d’intégrer dans mes thématiques de recherche actuelles le rôle trophique des invertébrés dans les écosystèmes aquatiques.

    Collaborations courantes :
    Arnaud Foulquier (UMR 5553, LECA, Grenoble)
    Eric Chauvet, Franck Gilbert (UMR 5245, ECOLAB, Toulouse)
    Benoit Cournoyer (UMR 5557, LEM, Lyon)
    Christophe Lecuyer, François Fourel (UMR 5276, LGL-TPE, Lyon)
    Thibault Datry, Ross Vander Vorste (IRSTEA, Lyon)

  • Florian Mermillod-Blondin, CR1 CNRS

    Depuis Janvier 2003 : Chargé de Recherche CNRS dans l’UMR 5023

    Avril-Décembre 2002 : Post doctorat à la Station de recherche Marine de Kristineberg (KMRS), Fiskebaeckskil, SWEDEN

    Janvier-Avril 2002 : Post doctorat à l’Institut des Sciences de la Mer, Rimouski, CANADA

    2000-2001 : ATER, Université Lyon 1

    2000 : Thèse de doctorat en Ecologie Fonctionnelle, Université Lyon 1

  • Sous Presse Lefébure, T., Morvan, C., Malard, F., François, C., Konecny-Dupré, L., Guéguen, L., Weiss-Gayet, M., Seguin-Orlando, A., Ermini L., Der Sarkissian, C., Charrier, N.P., Eme, D., Mermillod-Blondin, F., Duret, L., Vieira, C., Orlando, L., Douady, C. Less effective selection leads to larger genomes. Genome Research.

    2017 Vander Vorste, R., Mermillod-Blondin, F., Hervant, F., Mons, R., Datry, T., 2017 - Gammarus pulex (Crustacea: Amphipoda) avoids increasing water temperature and intraspecific competition through vertical migration into the hyporheic zone: a mesocosm experiment. Aquatic Sciences, 79 : 45-55.

    2016 Francois, C.M., Duret, L., Simon, L., Mermillod-Blondin, F., Malard, F., Konecny-Dupré, L., Planel, R., Penel, S., J. Douady, C., Lefébure, T., 2016 - No evidence that nitrogen limitation influences the elemental composition of isopod transcriptomes and proteomes. Molecular Biology and Evolution, 33(10) : 2605–2620.

    2016 François, C.M., Mermillod-Blondin, F., Malard, F., Fourel, F., Lécuyer, C., Douady, C.J., Simon, L., 2016 - Trophic ecology of groundwater species reveals specialization in a low-productivity environment. Functional Ecology, 30 : 262–273.

    2016 Pigneret, M., Mermillod-Blondin, F., Volatier, L., Romestaing, C., Maire, E., Adrien, J., Guillard, L., Roussel, D., Hervant, F., 2016 - Urban pollution of sediments: Impact on the physiology and burrowing activity of tubificid worms and consequences on biogeochemical processes. Science of the Total Environment, 568 : 196–207.

    2016 Vander Vorste, R., Mermillod-Blondin, F., Hervant, F., Mons, R., Forcellini, M., Datry, T., 2016 - Increased depth to the water table during river drying decreases the resilience of Gammarus pulex and alters ecosystem function. Ecohydrology, 9 : 1177-1186.

    2016 Voisin, J., Cournoyer, B.,, Mermillod-Blondin, F., 2016 - Assessment of artificial substrates for evaluating groundwater microbial quality. Ecological Indicators, 71 : 577–586.

    2015 Gette-Bouvarot, M., Mermillod-Blondin, F., Lemoine, D., Delolme, C., Danjean, M., Etienne, L., Volatier, L., 2015 - The potential control of benthic biofilm growth by macrophytes—A mesocosm approach. Ecological Engineering 75 : 178–186.

    2015 Gette-Bouvarot, M., Volatier, L., Lassabatère, L., Lemoine, D., Simon, L., Delolme, C., Mermillod-Blondin, F., 2015 - Ecological engineering approaches to improve hydraulic properties of infiltration basins designed for groundwater recharge. Environmental Science & Technology, 49 : 9936−9944.

    2015 Mermillod-Blondin, F., Simon, L., Maazouzi, C., Foulquier, A., Delolme, C., Marmonier, P., 2015 - Dynamics of dissolved organic carbon (DOC) through stormwater basins designed for groundwater recharge in urban area: Assessment of retention efficiency. Water Research, 81 : 27-37.

    2015 Mermillod-Blondin, F., Winiarski, T., Foulquier, A., Perrissin, A., Marmonier, P., 2015 - Links between sediment structures and ecological processes in the hyporheic zone: ground-penetrating radar as a non- invasive tool to detect subsurface biologically active zones. Ecohydrology, 8 : 626–641.

    2015 Voisin, J., Cournoyer, B.,, Mermillod-Blondin, F., 2015 - Utilisation de billes de verre comme substrats artificiels pour la caractérisation des communautés microbiennes dans les nappes phréatiques : mise au point méthodologique. La Houille Blanche, 4 : 2-57.

    2014 Cornut, J., Chauvet, E., Mermillod-Blondin, F., Assemat, F., Elger, A., 2014 - Aquatic Hyphomycete Species Are Screened by the Hyporheic Zone of Woodland Streams. Applied and Environmental Microbiology, 80(6) : 1949-1960.

    2014 Gette-Bouvarot, M., Mermillod-Blondin, F., Angulo-Jaramillo, R., Delolme, C., Lemoine, D., Lassabatere, L., Loizeau, S., Volatier, L., 2014 - Coupling hydraulic and biological measurements highlights the key influence of algal biofilm on infiltration basin performance. Ecohydrology, 7(3) : 950-964.

    2014 Mondy, N., Grossi, V., Cathalan, E., Delbecque, J.P., Mermillod-Blondin, F., Douady, C.J., 2014 - Sterols and steroids in a freshwater crustacean (Proasellus meridianus) : hormonal response to nutritional input. Invertebrate Biology, 133(1) : 99-107.

    2013 Marmonier, P., Maazouzi, C., Foulquier, A., Navel, S., François, C., Hervant, F., Mermillod-Blondin, F., Vienney, A., Barraud S., Togola, A., Piscart, C., 2013 - The use of crustaceans as sentinel organisms to evaluate groundwater ecological quality. Ecological Engineering, 57 : 118–132.


    2013 Mermillod-Blondin, F., Foulquier, A., Gilbert, F., Navel, S., Montuelle, B., Bellvert, F., Comte, G., Grossi , V., Fourel, F., Lecuyer, F., Simon, L., 2013 - Benzo(a)pyrene inhibits the role of the bioturbator Tubifex tubifex in river sediment biogeochemistry. Science of the Total Environment 450-451 : 230–241.

    2013 Mermillod-Blondin, F., Foulquier, A., Maazouzi, C., Navel, S., Negrutiu, Y., Vienney, A., Simon, L., Marmonier, P., 2013 - Ecological assessment of groundwater trophic status by using artificial substrates to monitor biofilm growth and activity. Ecological Indicators, 25 : 230–238.


    2013 Mermillod-Blondin, F., Lefour, C., Lalouette, L., Renault, D., Malard, F., Simon, L., Douady, C.J., 2013 - Thermal tolerance breadths among groundwater crustaceans living in a thermally constant environment. The Journal of Experimental Biology, 216 : 1683-1694.

    2013 Navel, S., Piscart, C., Mermillod-Blondin, F., Marmonier, P., 2013 - New methods for the investigation of leaf litter breakdown in river sediments. Hydrobiologia, 700 : 301–312.

    2013 Nogaro, G., Datry, T., Mermillod-Blondin, F., Foulquier, A., Montuelle, B., 2013 - Influence of hyporheic zone characteristics on the structure and activity of microbial assemblages. Freshwater Biology, 58 : 2567–2583.

    2012 Lemoine, D.G., Mermillod-Blondin, F., Barrat-Segretain, M.H., Massé, C., Malet, E., 2012 - The ability of aquatic macrophytes to increase root porosity and radial oxygen loss determines their resistance to sediment anoxia. Aquatic Ecology, 46(2) : 191-200.

    2012 Marmonier, P., Archambaud, G., Belaidi, N., Bougon, N., Breil, P., Chauvet, E., Claret, C., Cornut, J., Datry, T., Dole-Olivier, M.J., Dumont, B., Flipo, N., Foulquier, A., Gerino, M., Guilpart, A., Julien, F., Maazouzi, C., Martin, D., Mermillod-Blondin, F., Montuelle, B., Namour, P., Navel, S., Ombredane, D., Pelte, T., Piscart, C., Pusch, M., Stroffek, S., Robertson, A., Sanchez-Pérez, J.M., Sauvage, S., Taleb, A., Wantzen, M., Vervier, P., 2012 - The role of organisms in hyporheic processes: gaps in current knowledge, needs for future research and applications. Annales de Limnologie, International Journal of Limnology, 48 : 253-266.

    2012 Navel, S., Mermillod-Blondin, F., Montuelle, B., Chauvet, E., Marmonier, P., 2012 - Sedimentary context controls the influence of ecosystem engineering by bioturbators on microbial processes in river sediments. Oikos, 121 : 1134–1144.

    2012 Navel, S., Sauvage, S., Delmotte, S., Gerino, M., Marmonier P., Mermillod-Blondin, F., 2012 - A modelling approach to quantify the influence of fine sediment deposition on biogeochemical processes occurring in the hyporheic zone. Annales de Limnologie, International Journal of Limnology, 48 : 279-287.

Site de la Doua
Université Claude Bernard - Lyon I
CNRS, UMR 5023 - LEHNA (Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés)
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