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julien.clavel@univ-lyon1.fr
Julien Clavel
+33 (0)4 72 44 84 24 julien.clavel@univ-lyon1.fr
Université Claude Bernard Lyon 1 Bât. Forel - 6, rue Raphaël Dubois 69622 Villeurbanne - France
P3E
Chargé de Recherche CNRS

Je suis un biologiste de l’évolution dont les recherches visent, dans leur ensemble, à comprendre les processus qui ont généré, maintenu, et ultimement éliminé la diversité biologique au cours du temps. Pour cela, j’utilise et développe des approches analytiques, quantitatives et comparatives [en particulier les méthodes comparatives phylogénétiques], pour mieux comprendre les conséquences sur l’évolution de la diversité taxinomique et phénotypique des interactions entre espèces, ainsi que leurs interactions avec leurs environnements. Cette approche modélisatrice, associée à l’utilisation de données sur des organismes actuels et fossiles, me permet d’appréhender de manière unique les dynamiques évolutives sur des échelles de temps et d’espaces souvent inaccessibles par une approche expérimentale.


Responsabilités :
2025 - Membre du comité de la section 31 du CNRS
2021 / 2024 - Editeur Associé pour la revue 'Evolution'

Parcours académique :
2020 - CNRS Researcher
2018 / 2020 - Postdoctoral fellow (The Natural History Museum - London)
2014 / 2018 - Postdoctoral researcher (École Normale Supérieure - Paris)
2014 - PhD (University Claude Bernard Lyon 1 - Lyon)

Développement :
- mvMORPH “Multivariate comparative tools for fitting evolutionary models to morphometric data” (Auteur et créateur)
- RPANDA “Phylogenetic ANalysis of DiversificAtion. Implements macroevolutionary analyses on phylogenetic trees” (Auteur).
- glassoFast “glassoFast: a Fast Graphical LASSO” (Contributeur et mainteneur)

Mots-clés : biodiversité, macroévolution, paléobiologie, modélisation, phylogénétique, statistiques


I am an evolutionary biologist whose research aims to understand the processes that generated, maintained, and ultimately eliminated biological diversity over time. To this end, I use and develop analytical, quantitative, and comparative approaches [in particular, phylogenetic comparative methods] to better understand the consequences of interactions between species, as well as their interactions with their environments, on the evolution of taxonomic and phenotypic diversity. This modeling approach, combined with the use of data on extant and fossil organisms, allows me to better understand evolutionary dynamics on time and space scales that are often inaccessible through an experimental approach.

Responsibilities:
2025 - Member of the committee of the French National Center for Scientific Research (CNRS) - section 31 (evolutionary ecology and biology)
2021 / 2024 - Associate Editor for 'Evolution'

Academic:
2020 - CNRS Researcher
2018 / 2020 - Postdoctoral fellow (The Natural History Museum - London)
2014 / 2018 - Postdoctoral researcher (École Normale Supérieure - Paris)
2014 - PhD (University Claude Bernard Lyon 1 - Lyon)

Software development:
- mvMORPH “Multivariate comparative tools for fitting evolutionary models to morphometric data” (Author and creator)
- RPANDA “Phylogenetic ANalysis of DiversificAtion. Implements macroevolutionary analyses on phylogenetic trees” (Author).
- glassoFast “glassoFast: a Fast Graphical LASSO” (Contributor and maintainer)

Key-words: biodiversity, macroevolution, paleobiology, comparative phylogenetics, statistics

2025

Article dans une revue

titre
Ecological interactions and genomic innovation fueled the evolution of ray-finned fish endothermy
auteur
Fernando Melendez-Vazquez, Alexander Lucaci, Avery Selberg, Julien Clavel, Melissa Rincon-Sandoval, Aintzane Santaquiteria, William White, Danielle Drabeck, Giorgio Carnevale, Emanuell Duarte-Ribeiro, Masaki Miya, Mark Westneat, Carole Baldwin, Lily Hughes, Guillermo Ortí, Sergei Kosakovsky Pond, Ricardo Betancur-R, Dahiana Arcila
article
Science Advances , 2025, 11 (26), ⟨10.1126/sciadv.ads8488⟩
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https://hal.science/hal-05151179/file/Melendez-Vazquez%202025.pdf BibTex
titre
Morphological evolution in a time of phenomics
auteur
Anjali Goswami, Julien Clavel
article
Paleobiology, 2025, 51 (1), pp.195-213. ⟨10.1017/pab.2024.35⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-05058030/file/Goswami%20et%20al.%202025.pdf BibTex
titre
Testing the Impact of Prey Presentation Method on the Feeding Kinematics of Terrestrial and Aquatic Ambystomatidae
auteur
Isabelle Toussaint-Lardé, Vivien Louppe, Morgane Fournier, Julien Clavel, Anthony Herrel, Anne‐claire Fabre
article
Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological and Integrative Physiology, In press, ⟨10.1002/jez.70028⟩
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https://hal.science/hal-05246907/file/Toussaint-Larde%CC%81%20et%20al.%202025.pdf.pdf BibTex
titre
Complete metamorphosis promotes morphological and functional diversity in Caudata
auteur
Vivien Louppe, Kevin Le Verger, Julien Clavel, Gabriel Ferreira, Christina Kyriakouli, Edward Stanley, Emily Watt, Carla Bardua, Celeste Pérez-Ben, Nadia Fröbisch, Vivien Bothe, Renaud Boistel, Gheylen Daghfous, Anjali Goswami, Anne‐claire Fabre
article
Functional Ecology, 2025, 39, pp.1732-1747. ⟨10.1111/1365-2435.70044⟩
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https://hal.science/hal-05065961/file/Louppe%20et%20al.%202025.pdf BibTex
titre
Six million years of vole dental evolution shaped by tooth development
auteur
Fabien Lafuma, Élodie Renvoisé, Julien Clavel, Ian J Corfe, Gilles Escarguel
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2025, 122 (31), pp.e2505624122. ⟨10.1073/pnas.2505624122⟩
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https://hal.science/hal-05245152/file/Lafuma%20et%20al._2025_Six%20million%20years%20of%20vole%20dental%20evolutio.pdf BibTex

2024

Article dans une revue

titre
Limited ecological opportunity influences the tempo of morphological evolution in birds
auteur
Jonathan P Drury, Julien Clavel, Joseph A Tobias, Jonathan Rolland, Catherine Sheard, Hélène Morlon
article
Current Biology, 2024, 34, pp.1-9. ⟨10.1016/j.cub.2023.12.055⟩
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https://hal.science/hal-04406014/file/Drury%20et%20al.%202024.pdf BibTex

2023

Article dans une revue

titre
Diversity and evolution of cerebellar folding in mammals
auteur
Katja Heuer, Nicolas Traut, Alexandra A de Sousa, Sofie Valk, Julien Clavel, Roberto Toro
article
eLife, 2023, 12, pp.e85907. ⟨10.7554/eLife.85907⟩
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https://hal.science/hal-03933674/file/Heuer_et_al_2023.pdf BibTex
titre
Developmental origin underlies evolutionary rate variation across the placental skull
auteur
Anjali Goswami, Eve Noirault, Ellen Coombs, Julien Clavel, Anne-Claire Fabre, Thomas Halliday, Morgan Churchill, Abigail Curtis, Akinobu Watanabe, Nancy Simmons, Brian Beatty, Jonathan Geisler, David Fox, Ryan Felice
article
Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences, 2023, 378 (1880), ⟨10.1098/rstb.2022.0083⟩
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https://hal.science/hal-04155637/file/goswami-et-al-2023-developmental-origin-underlies-evolutionary-rate-variation-across-the-placental-skull.pdf BibTex
titre
Mammalian forelimb evolution is driven by uneven proximal-to-distal morphological diversity
auteur
Priscila Rothier, Anne-Claire Fabre, Julien Clavel, Roger Bj Benson, Anthony Herrel
article
eLife, 2023, 12 (e81492), ⟨10.7554/eLife.81492⟩
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https://hal.science/hal-04071845/file/rothier%20et%20al%202023.pdf BibTex

2022

Article dans une revue

titre
Attenuated evolution of mammals through the Cenozoic
auteur
Anjali Goswami, Eve Noirault, Ellen Coombs, Julien Clavel, Anne-Claire Fabre, Thomas Halliday, Morgan Churchill, Abigail Curtis, Akinobu Watanabe, Nancy Simmons, Brian Beatty, Jonathan Geisler, David Fox, Ryan Felice
article
Science, 2022, 378 (6618), pp.377-383. ⟨10.1126/science.abm7525⟩
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https://hal.science/hal-03839671/file/Goswami%20et%20al.%202022_manuscript.%20Attenuated.pdf BibTex
titre
The impact of paleoclimatic changes on body size evolution in marine fishes
auteur
Emily Troyer, Ricardo Betancur-R, Lily Hughes, Mark Westneat, Giorgio Carnevale, William White, John Pogonoski, James Tyler, Carole Baldwin, Guillermo Ortí, Andrew Brinkworth, Julien Clavel, Dahiana Arcila
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (29), pp.e2122486119. ⟨10.1073/pnas.2122486119⟩
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https://hal.science/hal-03805093/file/Troyer%20et%20al%202022.pdf BibTex
titre
The tempo of cetacean cranial evolution
auteur
Ellen J. Coombs, Ryan N. Felice, Julien Clavel, Travis Park, Rebecca Bennion, Morgan Churchill, Jonathan H. Geisler, Brian Beatty, Anjali Goswami
article
Current Biology, 2022, 32 (10), pp.2233-2247. ⟨10.1016/j.cub.2022.04.060⟩
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https://hal.science/hal-03666596/file/Coombs%20et%20al%202022.pdf BibTex
titre
Feeding strategies of circum‑Mediterranean hipparionins during the late Miocene: Exploring dietary preferences related to size through dental microwear analysis
auteur
Guillem Orlandi-Oliveras, Meike Köhler, Julien Clavel, Robert Scott, Serdar Mayda, Tanju Kaya, Gildas Merceron
article
Palaeontologia Electronica, 2022, 25 (1), pp.a13. ⟨10.26879/990⟩
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https://hal.science/hal-03663531/file/Orlandi-Oliveras.pdf BibTex

2021

Article dans une revue

titre
Size, microhabitat, and loss of larval feeding drive cranial diversification in frogs
auteur
Carla Bardua, Anne-Claire Fabre, Julien Clavel, Margot Bon, Kalpana Das, Edward L Stanley, David C Blackburn, Anjali Goswami
article
Nature Communications, 2021, 12 (1), ⟨10.1038/s41467-021-22792-y⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-03231761/file/2-Bardua%20et%20al%202021.pdf BibTex
titre
Multiple evolutionary origins and losses of tooth complexity in squamates
auteur
Fabien Lafuma, Ian J Corfe, Julien Clavel, Nicolas Di-Poï
article
Nature Communications, 2021, 12 (6001), ⟨10.1038/s41467-021-26285-w⟩
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https://hal.science/hal-03395195/file/4-lafuma%20et%20al.%202021.pdf BibTex
titre
Tempo and mode of morphological evolution are decoupled from latitude in birds
auteur
Jonathan P Drury, Julien Clavel, Joseph A Tobias, Jonathan Rolland, Catherine Sheard, Hélène Morlon
article
PLoS Biology, 2021, 19 (8), pp.e3001270. ⟨10.1371/journal.pbio.3001270⟩
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https://hal.science/hal-03347737/file/3-drury%20et%20al.%202021.pdf BibTex

2020

Article dans une revue

titre
A comparison of metrics for quantifying cranial suture complexity
auteur
Heather White, Julien Clavel, Abigail Tucker, Anjali Goswami
article
Journal of the Royal Society Interface, 2020, 17 (171), pp.20200476. ⟨10.1098/rsif.2020.0476⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02996152/file/1-White%20et%20al.2020..pdf BibTex
titre
Metamorphosis shapes cranial diversity and rate of evolution in salamanders
auteur
Anne-Claire Fabre, Carla Bardua, Margot Bon, Julien Clavel, Ryan Felice, Jeffrey Streicher, Jeanne Bonnel, Edward Stanley, David Blackburn, Anjali Goswami
article
Nature Ecology & Evolution, 2020, 4, pp.1129-1140. ⟨10.1038/s41559-020-1225-3⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02884774/file/Felice_Fabre_et_al_manuscript_Yellow.pdf BibTex
titre
Reliable Phylogenetic Regressions for Multivariate Comparative Data: Illustration with the MANOVA and Application to the Effect of Diet on Mandible Morphology in Phyllostomid Bats
auteur
Julien Clavel, Hélène Morlon
article
Systematic Biology, 2020, 69 (5), pp.927-943. ⟨10.1093/sysbio/syaa010⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02505243/file/7-Clavel%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
Evolution of communication signals and information during species radiation
auteur
Maxime Garcia, Frédéric Theunissen, Frédéric Sèbe, Julien Clavel, Andrea Ravignani, Thibaut Marin-Cudraz, Jérôme Fuchs, Nicolas Mathevon
article
Nature Communications, 2020, 11 (1), pp.4970. ⟨10.1038/s41467-020-18772-3⟩
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https://hal.science/hal-02961294/file/5-garcia%20et%20al%202020.pdf BibTex
titre
Convergent evolution of olfactory and thermoregulatory capacities in small amphibious mammals
auteur
Quentin Martinez, Julien Clavel, Jacob A Esselstyn, Anang S Achmadi, Camille Grohé, Nelly Pirot, Pierre-Henri Fabre
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117 (16), pp.8958-8965. ⟨10.1073/pnas.1917836117⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02538650/file/Martinez_et_al_2020_HAL.pdf BibTex
titre
Wonky whales: the evolution of cranial asymmetry in cetaceans
auteur
Ellen Coombs, Julien Clavel, Travis Park, Morgan Churchill, Anjali Goswami
article
BMC Biology, 2020, 18 (1), pp.1-24. ⟨10.1186/s12915-020-00805-4⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-02907425/file/8-Coombs%20et%20al%202020.pdf BibTex

2019

Article dans une revue

titre
A Penalized Likelihood Framework for High-Dimensional Phylogenetic Comparative Methods and an Application to New-World Monkeys Brain Evolution
auteur
Julien Clavel, Leandro Aristide, Hélène Morlon
article
Systematic Biology, 2019, 68 (1), pp.93-116. ⟨10.1093/sysbio/syy045⟩
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https://hal.science/hal-02408141/file/ClaveletalSystBio2018.pdf BibTex

2018

Article dans une revue

titre
Differential influences of allometry, phylogeny and environment on the rostral shape diversity of extinct South American notoungulates
auteur
Helder Gomes Rodrigues, Raphael Cornette, Julien Clavel, Guillermo H Cassini, Bart Anjan Bhullar, Marcos Fernandez-Monescillo, Karen Moreno, Anthony Herrel, Guillaume Billet
article
Royal Society Open Science, 2018, 5 (1), pp.171816. ⟨10.1098/rsos.171816⟩
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https://hal.science/hal-02105767/file/main.pdf BibTex

2016

Article dans une revue

titre
Accelerated body size evolution during cold climatic periods in the Cenozoic
auteur
Julien Clavel, Hélène Morlon
article
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2016, 114, pp.4183 - 4188. ⟨10.1073/pnas.1606868114⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03721200/file/ClavelMorlon2017PNAS.pdf BibTex

2015

Article dans une revue

titre
RPANDA : an R package for macroevolutionary analyses on phylogenetic trees
auteur
Hélène Morlon, Eric Lewitus, Fabien L. Condamine, Julien Clavel, Jonathan P Drury
article
Methods in Ecology and Evolution, 2015, 7 (5), pp.589-597. ⟨10.1111/2041-210X.12526⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-03048202/file/Morlon%20et%20al.%202016%20-%20MEE.pdf BibTex
titre
mwmorph : an R package for fitting multivariate evolutionary models to morphometric data
auteur
Julien Clavel, Gilles Escarguel, Gildas Merceron
article
Methods in Ecology and Evolution, 2015, 6 (11), pp.1311-1319. ⟨10.1111/2041-210.12420⟩
Accès au bibtex
BibTex

2014

Article dans une revue

titre
Missing data estimation in morphometrics: how much is too much?
auteur
Julien Clavel, Gildas Merceron, Gilles Escarguel
article
Systematic Biology, 2014, 63 (2), pp.203-18. ⟨10.1093/sysbio/syt100⟩
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BibTex
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