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Ecologie Evolution Ecosystèmes Souterrains

Responsable : F. Hervant

(E3S) étudie depuis plus de 60 ans la diversité biologique au sein du milieu souterrain et de ses interfaces avec les milieux de surface (mais aussi celles situées entre les écosystèmes aquatiques et terrestres, et entre hydrosystèmes et atmosphère), en favorisant la convergence de champs disciplinaires relevant de l’écologie et de l’évolution. Nos recherches se concentrent sur 4 axes principaux : évolution, écologie trophique, écologie des communautés et écologie fonctionnelle.

Membres

Nans Barthélémy

Nans Barthélémy

Chercheur post-doctoral

Axelle Braun Cecconi

Axelle Braun Cecconi

Ingénieure d'étude

Fanny COLAS

Fanny COLAS

Maitresse de conférences

mcouton

Marjorie Couton

Chercheuse post-doctorale

Perrine CRUAUD

Perrine CRUAUD

Maitresse de conférences

Sophie Darinot Thomas

Sophie Darinot Thomas

Ingénieure d'étude

christophe.douady

Christophe Douady

Professeur

Louis Duchemin

Louis Duchemin

Ingénieur de recherche

vincent.dufour

Vincent DUFOUR

Chercheur post-doctoral

Francois FOUREL

Francois FOUREL

Ingénieur de recherche Animateur de pôle

Frédéric Hervant

Frédéric Hervant

Maitre de conférences Animateur d’équipe

colin.issartel

Colin Issartel

Assistant Ingénieur

Lara KONECNY

Lara KONECNY

Assistante Ingénieure

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Emile Laymand

Chercheur post-doctoral

Tristan Lefébure

Tristan Lefébure

Professeur

Florian Malard

Florian Malard

Chargé de Recherche

Emma Mari

Emma Mari

Doctorante

Pierre Marmonier

Pierre Marmonier

Chercheur associé

Petros Mecaj

Petros Mecaj

Doctorant

Florian MERMILLOD-BLONDIN

Florian MERMILLOD-BLONDIN

Directeur de Recherche

Samuel Mouron

Samuel Mouron

Doctorant

Johan Pansu

Johan Pansu

Maitre de conférences

Zoraida Quiñones-Rivera

Zoraida Quiñones-Rivera

Chercheuse CDD

Wassim SERBOUTE

Wassim SERBOUTE

Laurent Simon

Laurent Simon

Maitre de conférences

Mathieu Tocaben

Mathieu Tocaben

Ingénieur d'étude

Nicolas

Nicolas VAGANAY

Doctorant

Félix Vallier

Félix Vallier

Technicien Animateur de pôle

Manon Vallier

Manon Vallier

Ingénieure d'étude

Mohammad Wazne

Mohammad Wazne

Chercheur post-doctoral

Björn Wissel

Björn Wissel

Professeur

Publications

Publications HAL de la structure 1002323;391750

2025

Article dans une revue

titre
CODABEILLES: a reliable reference library of COI DNA barcodes for French wild bees monitoring (Apoidea: Anthophila)
auteur
Mélodie Ollivier, Anaïs Marquisseau, Éric Dufrêne, Rémi Rudelle, Rodolphe Rougerie, Adrien Perrard, Magalie Pichon, Emilie Andrieu, Emmanuelle Artige, Matthieu Aubert, Yvan Brugerolles, Alexandre Cornuel-Willermoz, Raphaël da Silva Ropio, Adeline Dumet, David Genoud, Benoît Geslin, Laurent Guilbaud, Bernard Kaufmann, Lara Konecny, Anne-Laure Jacquemart, Danny Lebreton, Vincent Leclercq, Gabriel Nève, Annie Ouin, Christophe Philippe, Bertrand Schatz, Jean-Claude Streito, Héloïse Vallod
article
BMC Ecology and Evolution, 2025, 25 (1), pp.121. ⟨10.1186/s12862-025-02429-0⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-05383188/file/2025-Ollivier-BMCEcolEvol.pdf BibTex
titre
Combined effects of application-specific plastic composition and environmental conditions on algal pigments and microbial activity of freshwater biofilms
auteur
Camille M Touchet, Florian Mermillod-Blondin, Sylvain Dolédec, Zoraida J Quiñones-Rivera, Ludovic Guillard, Laurence Volatier, Félix Vallier, Marjolaine Rey, Stefan Krause, Laurent Simon
article
Environmental Pollution, 2025, 387, pp.127323. ⟨10.1016/j.envpol.2025.127323⟩
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https://hal.science/hal-05338470/file/1-s2.0-S0269749125016975-main.pdf BibTex
titre
Environmental radioactivity impacts bioenergetic in tree frog of Fukushima
auteur
Lea Dasque, Damien Roussel, Jean-Marc Bonzom, Olivier Armant, Clément Car, Kenji Nanba, Hiroko Ishiniwa, Toshihiro Wada, Ikuo Miura, Vanessa Gardette, Virginie Camilleri, Laurent Simon, Marie-Laure Delignette-Muller, Sandrine Frelon, Nathalie Mondy
article
Environmental Pollution, In press, pp.127147. ⟨10.1016/j.envpol.2025.127147⟩
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https://hal.science/hal-05283164/file/Dasque%20preprint.pdf BibTex
titre
Morpho‐ecological restoration in braided rivers: the need to account for geomorphological heterogeneity
auteur
Lise Devreux, Barbara Belletti, Sylvain Dolédec, Pierre Marmonier, Margot Chapuis
article
River Research and Applications, In press, ⟨10.1002/rra.70033⟩
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BibTex
titre
Caught in a bad romance: Microbiota increases glyphosate toxicity in the Asian tiger mosquito Aedes albopictus
auteur
Pierre Antonelli, Laurent Vallon, Edwige Martin, Séverine Balmand, Sylvie Guibert, Anne Baudouin, Laurent Simon, Aurélien Vigneron, Guillaume Minard, Claire Valiente Moro
article
Environmental Pollution, 2025, 381, pp.126651. ⟨10.1016/j.envpol.2025.126651⟩
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https://hal.science/hal-05220925/file/2025_Antonelli_Env_Pollution.pdf BibTex
titre
Relative Effects of Eutrophication and Warming on Freshwater Ecosystems Across Ecological Levels
auteur
Valentin Marin, Fanny Colas, Stéphanie Boulêtreau, Julien Cucherousset
article
Global Change Biology, 2025, 31 (8), ⟨10.1111/gcb.70410⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-05240218/file/Global%20Change%20Biology%20-%202025%20-%20Marin%20-%20Relative%20Effects%20of%20Eutrophication%20and%20Warming%20on%20Freshwater%20Ecosystems%20Across.pdf BibTex
titre
Greenhouse gas dynamics in fishponds: management versus environmental controls in a complex aqua-agriculture system, France
auteur
Emma Mari, Fanny Colas, Sylvain Dolédec, Anas M. Usoof, Jules Blanc, Björn Wissel
article
Journal of Environmental Management, 2025, 390, pp.126357. ⟨10.1016/j.jenvman.2025.126357⟩
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BibTex
titre
Microplastics storage at the sediment-water interface in a gravel-bed river: Importance of local hydro-sedimentary conditions in downwelling, upwelling, and sedimentation zones
auteur
Mohammad Wazne, Laurent Simon, Stefan Krause, Manon Vallier, André-Marie Dendievel, Camille M Touchet, Brice Mourier, Gilles Montagnac, Florian Mermillod-Blondin
article
Water Research, 2025, 279, pp.123433. ⟨10.1016/j.watres.2025.123433⟩
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https://hal.science/hal-05109751/file/Wazne_Manuscript.pdf BibTex
titre
Small Water Impoundments Have Local and Longitudinal Impacts on Carbon Cycling Along a River Network
auteur
Teresa Silverthorn, Vincent Chanudet, Fanny Colas, Romain Sarremejane, Abdelkader Azougui, Thibault Datry
article
River Research and Applications, In press, ⟨10.1002/rra.70002⟩
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BibTex
titre
Transcriptomic basis of within- and trans-generational predator-induced plasticity in the freshwater snail Physa acuta
auteur
Léo Dejeux, Nathanaëlle Saclier, Juliette Tariel-Adam, Maxime Hoareau, Tristan Lefébure, Lara Konecny, Sandrine Plénet, Emilien Luquet
article
Heredity, 2025, 134 (7), pp.439-449. ⟨10.1038/s41437-025-00775-9⟩
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https://hal.science/hal-05149970/file/Dejeux%20et%20al.%202025.Preprint.pdf BibTex
titre
Potential impacts of floating photovoltaics on carbon fluxes across aquatic-terrestrial boundaries
auteur
Paul Vouhe, Héctor Rodríguez-Pérez, Björn Wissel, Thierry Lengagne, Anne Metaireau, Fanny Colas
article
Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2025, 426, pp.13. ⟨10.1051/kmae/2025005⟩
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BibTex
titre
Increased assimilation efficiency and mortality rate in Gammarus fossarum exposed to PVC microplastics
auteur
Nans Barthelemy, Florian Mermillod-Blondin, Anabelle Espeyte, Mohammad Wazne, Frédéric Hervant, Ghislaine Broillet, Davide Degli-Esposti, Arnaud Chaumot, Stefan Krause, Laurent Simon, Thibault Datry
article
Environmental Pollution, 2025, 372, pp.126029. ⟨10.1016/j.envpol.2025.126029⟩
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https://hal.science/hal-05099610/file/Barthe%CC%81le%CC%81my%20et%20al.%202025.pdf BibTex
titre
Variation in the fitness impact of translationally optimal codons among animals
auteur
Florian Bénitière, Tristan Lefébure, Laurent Duret
article
Genome Research, 2025, 35 (3), pp.446-458. ⟨10.1101/gr.279837.124⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04737716/file/B%C3%A9niti%C3%A8re%20et%20al.%20-%202025%20-%20Variation%20in%20the%20fitness%20impact%20of%20translationally.pdf BibTex
titre
Floating photovoltaics strongly reduce water temperature: A whole-lake experiment
auteur
Regina L.G. Nobre, Chloé Vagnon, Stéphanie Boulêtreau, Fanny Colas, Frédéric Azémar, Loïc Tudesque, Nathalie Parthuisot, Paul Millet, Julien Cucherousset
article
Journal of Environmental Management, 2025, 375, pp.124230. ⟨10.1016/j.jenvman.2025.124230⟩
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BibTex
titre
Oxygen and sulfur stable isotope ratios of Late Devonian vertebrates trace the relative salinity of their aquatic environments
auteur
Jean Goedert, David Broussard, Jeffrey Trop, Edward Daeschler, Romain Amiot, François Fourel, Sébastien Olive, Arnauld Vinçon-Laugier, Christophe Lécuyer
article
Geological Society of America Bulletin, 2025, ⟨10.1130/B37631.1⟩
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https://hal.science/hal-04769137/file/Goedert%20et%20al.pdf BibTex
titre
Description and use of Schellencandona rhodanensis sp. n. (Ostracoda, Candoninae) to locate groundwater upwelling zones in rivers and wetlands
auteur
Colin Issartel, Pierre Marmonier
article
International Journal of Limnology, 2025, 61 (2), pp.1-13. ⟨10.1051/limn/2025001⟩
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https://hal.science/hal-04934201/file/limn240040.pdf BibTex
titre
Unveiling Structure of Tropical Estuarine Communities Through eDNA and Implications for Biomonitoring
auteur
Johan Pansu, Christine Chivas, Geoffrey Carlin, Jacob Gruythuysen, Marcelo Merten Cruz, Rachael A Smith, Frédérique Viard, Stuart L Simpson, Anthony A Chariton
article
Environmental DNA, 2025, 7 (4), pp.e70180. ⟨10.1002/edn3.70180⟩
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https://hal.science/hal-05245293/file/Pansu%20et%20al.%202025.pdf BibTex
titre
Zooming in the plastisphere: the ecological interface for phytoplankton–plastic interactions in aquatic ecosystems
auteur
Veronica Nava, Jaffer Dar, Vanessa de Santis, Lena Fehlinger, Julia Pasqualini, Oloyede Adekolurejo, Bryan Burri, Marco Cabrerizo, Teofana Chonova, Mathilde Cour, Flavia Dory, Annemieke Drost, Aida Figler, Giulia Gionchetta, Dariusz Halabowski, Daniel Harvey, Víctor Manzanares-Vázquez, Benjamin Misteli, Laureen Mori-Bazzano, Valentin Moser, Federica Rotta, Bianca Schmid-Paech, Camille Touchet, Julia Gostyńska
article
Biological Reviews, 2025, 100, pp.834-854. ⟨10.1111/brv.13164⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-04823445/file/Nava%20et%20al.%20-%20Zooming%20in%20the%20plastisphere%20the%20ecological%20interf.pdf BibTex
titre
Advancing subterranean conservation through Global Research on eDNA in Groundwaters (GReG)
auteur
Mattia Saccò, Abdul Elmasri, Mahima Tawal, Roman Alther, Florian Altermatt, Alejandro Martínez, Stefano Mammola, Maja Zagmajster, Pablo Saenz-Agudelo, Miwa Takahashi, Jake Thornhill, Aude Andouche, Mariella Baratti, Muhammad Bilal, Helena Bilandžija, Rossano Bolpagni, Sarah Boulamail, Fulvio Celico, Claire A Chauveau, Efrain Chavez, Olivier Collard, Steven J B Cooper, Marjorie Couton, Francesco Cozzoli, Kat Dawkins, Tiziana Di Lorenzo, Ximena Dubinsky, Hans Jürgen Hahn, Jean-François Flot, Fabien Glatting, Christian Griebler, Simone Guareschi, Tamar Guy-Haim, Shane Herbert, Grant Hose, William F Humphreys, Benjamin Hutchins, Sanda Iepure, Tim Johns, Clemens Karwautz, Dominik Kirschner, Oren Kolodny, Marjeta Konec, Raoul Manenti, Tarik Meziane, Nataša Mori, Elena Pazhenkova, Maxine P Piggott, Alejandra Prieto-Davó, Zoé Raphalen, Hannah Rau, Ana Sofia Reboleira, Hans Recknagel, Anne Robertson, Coline Royaux, Benjamin Schwartz, Klaus Schwenk, Nuno Simoes, David Stanković, Fabio Stoch, Joe D Taylor, Mieke van der Heyde, Živa Vehovar, Valerija Zakšek, Nicole E White, Morten E Allentoft, Paul Nevill, Kathryn L Korbel, Michelle T Guzik
article
Subterranean Biology, 2025, 53, pp.31-40. ⟨10.3897/subtbiol.53.165710⟩
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https://hal.science/hal-05272878/file/Sacco%CC%80%20et%20al.%202025.pdf BibTex
titre
Diatom assemblages colonizing floating photovoltaic floaters are distinct from those in benthic and pelagic compartments of gravel pit lakes
auteur
Regina Lucia Guimarães Nobre, Julien Cucherousset, Stéphanie Boulêtreau, Frédéric Azémar, Nathalie Parthuisot, Fanny Colas, Paul Millet, Loïc Tudesque
article
Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 2025, Ecological, evolutionary and environmental implications of floating photovoltaics, 426, pp.10. ⟨10.1051/kmae/2025006⟩
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https://hal.science/hal-05075544/file/Nobre%20et%20al%202025.pdf BibTex
titre
Les poissons plats (Pleuronectidae) au menu à Abbeville au XVIe siècle (France). L’apport de l’ostéométrie et des isotopes stables à l’identification des espèces et des zones de pêche
auteur
Elise Dufour, Benoit Clavel, Olivier Tombret, Laurent Simon
article
Cybium : Revue Internationale d’Ichtyologie, 2025, 49 (1), pp.5-28. ⟨10.26028/cybium/2025-006⟩
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https://hal.science/hal-05033426/file/Dufour%20et%20al._Cybium_2025.pdf BibTex
titre
Monitoring of stable isotope composition of precipitation reveals thunderstorm dynamics
auteur
Ana-Voica Bojar, Christophe Lécuyer, Hans-Peter Bojar, François Fourel, Stanislaw Chmiel
article
Isotopes in Environmental and Health Studies, 2025, 61 (1), pp.1-16. ⟨10.1080/10256016.2024.2380059⟩
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https://hal.science/hal-04885531/file/Monitoring%20of%20stable%20isotope%20composition%20of%20precipitation%20reveals%20thunderstorm%20dynamics.pdf BibTex
titre
Environmental organic carbon availability determines metabolic and consumption rates in freshwater isopods
auteur
Florian Mermillod-Blondin, Christophe J Douady, Clémentine M François, Frédéric Hervant, Laurent Simon
article
Oikos, In press, ⟨10.1002/oik.11149⟩
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https://hal.science/hal-05095703/file/Mermillod-Blondin%20et%20al.%202025_preprint.pdf BibTex
titre
Elusive tropical forest canopy diversity revealed through environmental DNA contained in rainwater
auteur
Lucie Zinger, Anne-Sophie Benoiston, Yves Cuenot, Céline Leroy, Eliane Louisanna, Lucie Moreau, Frédéric Petitclerc, Finn Piatscheck, Jérôme Orivel, Cécile Richard-Hansen, Lou Hansen-Chaffard, Uxue Suescun, Valérie Troispoux, Frédéric Boyer, Jérôme Chave, Thibaud Decaëns, Antoine Fouquet, Johan Pansu, Jérémy Raynaud, Rodolphe Rougerie, Lucas Sire, Heidy Schimann, Pierre Taberlet, Amaia Iribar
article
Science Advances , 2025, 11 (33), pp.eadx4909. ⟨10.1126/sciadv.adx4909⟩
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https://hal.science/hal-05220607/file/Elusive%20tropical%20forest%20canopy%20diversity.pdf BibTex
titre
Transcriptomic data reveal divergent paths of chitinase evolution underlying dietary convergence in anteaters and pangolins
auteur
Rémi Allio, Sophie Teullet, Dave Lutgen, Amandine Magdeleine, Rachid Koual, Marie-Ka Tilak, Benoît de Thoisy, Christopher A Emerling, Tristan Lefébure, Frédéric Delsuc
article
Genome Biology and Evolution, 2025, 17 (2), pp.evaf002. ⟨10.1093/gbe/evaf002⟩
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https://hal.science/hal-04890530/file/evaf002.pdf BibTex

2024

Article dans une revue

titre
A second species of Stenasellus Dollfus, 1897 (Isopoda, Stenasellidae) from sulfidic groundwater of Iran described using morphological and molecular methods
auteur
Jure Jugovic, Mohammad Javad Malek-Hosseini, Colin Issartel, Lara Konecny-Dupré, Matjaž Kuntner, Yaser Fatemi, Jean-François Flot, Christophe Douady, Florian Malard
article
European Journal of Taxonomy, 2024, 968, ⟨10.5852/ejt.2024.968.2733⟩
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BibTex
titre
The Inca child of the Quehuar volcano: Stable isotopes clue to geographic origin and seasonal diet, with putative seaweed consumption
auteur
Eve Poulallion, Violeta Galván, Verónica Seldes, María Fernanda Zigarán, Gabriela Recagno Browning, François Fourel, Thibault Clauzel, Jean-Pierre Flandrois, Nicolas Séon, Laurent Simon, Romain Amiot, Christophe Lécuyer
article
Journal of Archaeological Science: Reports, 2024, 59, pp.104784. ⟨10.1016/j.jasrep.2024.104784⟩
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https://hal.science/hal-04741268/file/1-s2.0-S2352409X24004127-main.pdf BibTex
titre
Environmental DNA Particle Size Distribution and Quantity Differ Across Taxa and Organelles
auteur
Héloïse Verdier, T. Datry, Maxime Logez, Lara Konecny-Dupré, Maïlys Gauthier, Tristan Lefébure
article
Environmental DNA, 2024, 6 (5), pp.e598. ⟨10.1002/edn3.598⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04739432/file/Environmental%20DNA%20-%202024%20-%20Verdier%20-%20Environmental%20DNA%20Particle%20Size%20Distribution%20and%20Quantity%20Differ%20Across%20Taxa%20and.pdf BibTex
titre
Effective population size does not explain long-term variation in genome size and transposable element content in animals
auteur
Alba Marino, Gautier Debaecker, Anna-Sophie Fiston-Lavier, Annabelle Haudry, Benoit Nabholz
article
eLife, In press, ⟨10.7554/eLife.100574.1⟩
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BibTex
titre
The Duration of Dry Events Promotes PVC Film Fragmentation in Intermittent Rivers
auteur
Nans Barthélémy, Florian Mermillod-Blondin, Stefan Krause, Laurent Simon, Louise Mimeau, Alexandre Devers, Jean-Philippe Vidal, T. Datry
article
Environmental Science and Technology, 2024, 58 (28), pp.12621-12632. ⟨10.1021/acs.est.4c00528⟩
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https://hal.inrae.fr/hal-04660274/file/Barthelemy%20et%20al.%202024.pdf BibTex
titre
Human activities shape global patterns of decomposition rates in rivers
auteur
Scott Tiegs, Krista A Capps, David Costello, John Paul Schmidt, Christopher J Patrick, J. Follstad Shah, Carri J Leroy, Vicenç Acuña, Ricardo Albariño, Daniel Allen, Cecilia Alonso, Patricio Andino, Clay Arango, Jukka Aroviita, Marcus V.M. Barbosa, Leon Barmuta, Colden Baxter, Brent Bellinger, Luz Boyero, Lyubov Bragina, Lee Brown, Andreas Bruder, Denise Bruesewitz, Francis Burdon, Marcos Callisto, Antonio Camacho, Cristina Canhoto, María Castillo, Eric Chauvet, Joanne Clapcott, Fanny Colas, Checo Colón-Gaud, Julien Cornut, Verónica Crespo-Pérez, Wyatt Cross, Joseph Culp, Michael Danger, Olivier Dangles, Elvira de Eyto, Alison Derry, Veronica Díaz Villanueva, Michael Douglas, Arturo Elosegi, Andrea Encalada, Sally Entrekin, Rodrigo Espinosa, Verónica Ferreira, Carmen Ferriol, Kyla Flanagan, Alexander Flecker, Tadeusz Fleituch, André Frainer, Nikolai Friberg, Paul Frost, Erica Garcia, Liliana García-Lago, Pavel Ernesto García Soto, Mark Gessner, Sudeep Ghate, Darren Giling, Alan Gilmer, José Francisco Gonçalves, Rosario Karina Gonzales, Manuel A.S. Graça, Mike Grace, Natalie Griffiths, Hans-Peter Grossart, François Guérold, Vlad Gulis, Pablo Gutiérrez-Fonseca, Luiz Hepp, Scott Higgins, Takuo Hishi, Joseph Huddart, John Hudson, Moss Imberger, Carlos Iñiguez-Armijos, Mark Isken, Tomoya Iwata, David Janetski, Andrea Kirkwood, Aaron Koning, Sarian Kosten, Kevin Kuehn, Hjalmar Laudon, Peter Leavitt, Aurea Lemes da Silva, Shawn Leroux, Peter Lisi, Richard Mackenzie, Amy Marcarelli, Frank Masese, Peter Mcintyre, Brendan Mckie, Adriana Medeiros, Kristian Meissner, Marko Miliša, Shailendra Mishra, Yo Miyake, Ashley Moerke, Shorok Mombrikotb, Rob Mooney, Timothy Moulton, Timo Muotka, Junjiro Negishi, Vinicius Neres-Lima, Mika Nieminen, Jorge Nimptsch, Jakub Ondruch, Riku Paavola, Isabel Pardo, Edwin T.H.M. Peeters, Jesus Pozo, Aaron Prussian, Estefania Quenta, Brian Reid, John Richardson, Anna Rigosi, José Rincón, Geta Risnoveanu, Christopher Robinson, Lorena Rodríguez-Gallego, Todd Royer, James Rusak, Anna Santamans, Géza Selmeczy, Gelas Simiyu, Agnija Skuja, Jerzy Smykla, Ryan Sponseller, Kandikere Sridhar, Aaron Stoler, Christopher Swan, Franco Teixeira de Mello, Jonathan Tonkin, Sari Uusheimo, Allison Veach, Sirje Vilbaste, Lena B.-M. Vought, Chiao-Ping Wang, Jackson Webster, Paul Wilson, Stefan Woelfl, Guy Woodward, Marguerite Xenopoulos, Adam Yates, Chihiro Yoshimura, Catherine Yule, Yixin Zhang, Jacob Zwart
article
Science, 2024, 384 (6701), pp.1191-1195. ⟨10.1126/science.adn1262⟩
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https://hal.science/hal-04652223/file/adn1262_R2_clean_v3_noSM_ACCEPTED.pdf BibTex
titre
Impacts of hydrologic management on the eutrophication of shallow lakes in an intensive agricultural landscape (Saskatchewan, Canada)
auteur
Cale a C Gushulak, Amir M Chegoonian, Jared Wolfe, Kristen Gray, Stefano Mezzini, Bjoern Wissel, Brenda Hann, Helen M Baulch, Kerri Finlay, Peter R Leavitt
article
Freshwater Biology, 2024, 69, pp.984 - 1000. ⟨10.1111/fwb.14260⟩
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https://hal.science/hal-04835427/file/Freshwater%20Biology%20-%202024%20-%20Gushulak%20-%20Impacts%20of%20hydrologic%20management%20on%20the%20eutrophication%20of%20shallow%20lakes%20in%20an.pdf BibTex
titre
GTDrift: a resource for exploring the interplay between genetic drift, genomic and transcriptomic characteristics in eukaryotes
auteur
Florian Bénitière, Laurent Duret, Anamaria Necsulea
article
NAR Genomics and Bioinformatics, 2024, 6 (2), pp.lqae064. ⟨10.1093/nargab/lqae064⟩
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https://cnrs.hal.science/hal-04609512/file/Be%CC%81nitie%CC%80re%20et%20al.%20-%202024%20-%20GTDrift%20a%20resource%20for%20exploring%20the%20interplay%20be.pdf BibTex
titre
Faire place nette pour la transformation fromagère
auteur
Mathilde Lagrola
article
Revue d'Anthropologie des Connaissances, 2024, 18 (2), ⟨10.4000/11r9p⟩
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BibTex
titre
Optimization of glass separating funnels to facilitate microplastic extraction from sediments
auteur
Mohammad Wazne, Florian Mermillod-Blondin, Manon Vallier, Stefan Krause, Nans Barthélémy, Laurent Simon
article
MethodsX, 2024, 12, pp.102540. ⟨10.1016/j.mex.2023.102540⟩
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https://hal.science/hal-04408775/file/2024-Wazne-MethodsX.pdf BibTex
titre
Environmental DNA highlights the influence of salinity and agricultural run-off on coastal fish assemblages in the Great Barrier Reef region
auteur
Aashi Parikh, Johan Pansu, Adam Stow, Michael St J. Warne, Christine Chivas, Paul Greenfield, Frédéric Boyer, Stuart Simpson, Rachael Smith, Jacob Gruythuysen, Geoffrey Carlin, Natalie Caulfield, Frédérique Viard, Anthony A Chariton
article
Environmental Pollution, 2024, 349, pp.123954. ⟨10.1016/j.envpol.2024.123954⟩
Accès au texte intégral et bibtex
https://hal.science/hal-04550427/file/Parikh_2024_EnvPoll.pdf BibTex
titre
The relationships between biotic uniqueness and abiotic uniqueness are context dependent across drainage basins worldwide
auteur
Henna Snåre, Jorge García-Girón, Janne Alahuhta, Luis Mauricio Bini, Pál Boda, Núria Bonada, Leandro Brasil, Marcos Callisto, Diego Castro, Kai Chen, Zoltán Csabai, Thibault Datry, Sami Domisch, Jaime García-Marquez, Mathieu Floury, Nikolai Friberg, Brian Gill, Juan David González-Trujillo, Emma Göthe, Peter Haase, Neusa Hamada, Matthew Hill, Jan Hjort, Leandro Juen, Jonathan Jupke, Ana Paula Justino de Faria, Zhengfei Li, Raphael Ligeiro, Marden Linares, Ana Luiza-Andrade, Diego Macedo, Kate Mathers, Andres Mellado-Diaz, Djuradj Milosevic, Nabor Moya, N. Leroy Poff, Robert Rolls, Fabio Roque, Victor Saito, Leonard Sandin, Ralf Schäfer, Alberto Scotti, Tadeu Siqueira, Renato Tavares Martins, Francisco Valente-Neto, Beixin Wang, Jun Wang, Zhicai Xie, Jani Heino
article
Landscape Ecology, 2024, 39 (4), pp.86. ⟨10.1007/s10980-024-01883-3⟩
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titre
Both nuclear and cytoplasmic polymorphisms are involved in genetic conflicts over male fertility in the gynodioecious snail, Physa acuta
auteur
Fanny Laugier, Nathanaëlle Saclier, Kévin Béthune, Axelle Braun, Lara Konecny-Dupré, Tristan Lefébure, Émilien Luquet, Sandrine Plénet, Jonathan Romiguier, Patrice David
article
Evolution - International Journal of Organic Evolution, 2024, 78 (7), pp.1227-1236. ⟨10.1093/evolut/qpae053⟩
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https://hal.science/hal-04707802/file/HAL%20version_laugier%20et%20al%202024%20cytonuclear%20determination%20of%20male%20sterility%20in%20physa%20Evolution%20with%20supplements.pdf BibTex
titre
Drying and fragmentation drive the dynamics of resources, consumers and ecosystem functions across aquatic‐terrestrial habitats in a river network
auteur
Romain Sarremejane, Teresa Silverthorn, Angélique Arbaretaz, Amélie Truchy, Nans Barthélémy, Naiara López-Rojo, Arnaud Foulquier, Laurent Simon, Hervé Pella, Gabriel Singer, T. Datry
article
Oikos, 2024, 2024 (6), ⟨10.1111/oik.10135⟩
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titre
The global genetic diversity of planktonic foraminifera reveals the structure of cryptic speciation in plankton
auteur
Raphaël Morard, Kate Darling, Agnes Weiner, Christiane Hassenrück, Chiara Vanni, Tristan Cordier, Nicolas Henry, Mattia Greco, Nele Vollmar, Tamara Milivojevic, Shirin Nurshan Rahman, Michael Siccha, Julie Meilland, Lukas Jonkers, Frédéric Quillévéré, Gilles Escarguel, Christophe Douady, Thibault de Garidel-Thoron, Colomban de Vargas, Michal Kucera
article
Biological Reviews, 2024, 99 (4), pp.1218-1241. ⟨10.1111/brv.13065⟩
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https://univ-lyon1.hal.science/hal-04552961/file/Biological%20Reviews%20-%202024%20-%20Morard%20-%20The%20global%20genetic%20diversity%20of%20planktonic%20foraminifera%20reveals%20the%20structure%20of.pdf BibTex
titre
Regional heterothermies recorded in the oxygen isotope composition of harbour seal skeletal elements
auteur
Nicolas Séon, Romain Amiot, Guillaume Suan, Christophe Lécuyer, François Fourel, Arnauld Vinçon-Laugier, Sylvain Charbonnier, Peggy Vincent
article
Journal of Thermal Biology, 2024, 120, pp.103825. ⟨10.1016/j.jtherbio.2024.103825⟩
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https://hal.science/hal-04633815/file/S%C3%A9on%20et%20al._2024_Harbour%20seal_accepted_version.pdf BibTex
titre
Salinity causes widespread restriction of methane emissions from small inland waters
auteur
Cynthia Soued, Matthew J Bogard, Kerri Finlay, Lauren E Bortolotti, Peter R Leavitt, Pascal Badiou, Sara H Knox, Sydney Jensen, Peka Mueller, Sung Ching Lee, Darian Ng, Björn Wissel, Chun Ngai Chan, Bryan Page, Paige Kowal
article
Nature Communications, 2024, 15, pp.425 - 436. ⟨10.1038/s41467-024-44715-3⟩
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https://hal.science/hal-04835396/file/Soued%20et%20al%20Nature%202024.pdf BibTex
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Understanding the complex dynamics of zebra mussel invasions over several decades in European rivers: drivers, impacts and predictions
auteur
Phillip Haubrock, Ismael Soto, Melina Kourantidou, Danish Ahmed, Ali Serhan Tarkan, Paride Balzani, Kristi Bego, Antonín Kouba, Sadi Aksu, Elizabeta Briski, Francisco Sylvester, Vanessa de Santis, Gaït Archambaud-Suard, Núria Bonada, Miguel Cañedo-Argüelles, Zoltán Csabai, Thibault Datry, Mathieu Floury, Jean‐françois Fruget, John Iwan Jones, Marie‐helene Lizee, Anthony Maire, John Murphy, Davis Ozolins, Jes Jessen Rasmussen, Agnija Skuja, Gábor Várbíró, Piet Verdonschot, Ralf Verdonschot, Peter Wiberg-Larsen, Ross Cuthbert
article
Oikos, 2024, ⟨10.1111/oik.10283⟩
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https://hal.science/hal-04410363/file/Oikos%20-%202024%20-%20Haubrock%20-%20Understanding%20the%20complex%20dynamics%20of%20zebra%20mussel%20invasions%20over%20several%20decades%20in%20European.pdf BibTex
titre
Interplay of competition and facilitation in grazing succession by migrant Serengeti herbivores
auteur
T. Michael Anderson, Staci Hepler, Ricardo Holdo, Jason Donaldson, Robert Erhardt, J. Grant C. Hopcraft, Matthew Hutchinson, Sarah Huebner, Thomas Morrison, Jeffry Muday, Issack Munuo, Meredith Palmer, Johan Pansu, Robert Pringle, Robert Sketch, Craig Packer
article
Science, 2024, 383 (6684), pp.782-788. ⟨10.1126/science.adg0744⟩
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https://hal.science/hal-04461495/file/pre%CC%81print%20Anderson%20et%20al.pdf BibTex
titre
Multidimensional trait space outlines the effects of changes in abiotic filtering on aquatic plant community from sub-Antarctic ponds
auteur
Pauline Douce, Pauline Eymar-Dauphin, Hugo Saiz, David Renault, Florian Mermillod-Blondin, Laurent Simon, Félix Vallier, Anne-Kristel Bittebiere
article
Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 2024, 64, pp.125798. ⟨10.1016/j.ppees.2024.125798⟩
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https://hal.science/hal-04649253/file/1-s2.0-S1433831924000210-main.pdf BibTex
titre
Forest and agricultural dynamics in the Haouz plain over the last millennium: archaeobotanical and isotopic research at Aghmat (Morocco)
auteur
Jérôme Ros, Fatima-Ezzahra Badri, Amandine Cartier, Benoit Marie, Abdallah Fili, Chloé Capel, Leïa Mion, Sandrine Canal, François Fourel, Violaine Heritier-Salama, Laurent Bouby, Ilham Bentaleb
article
Human Ecology, 2024, 52 (2), pp.255-271. ⟨10.1007/s10745-024-00507-3⟩
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https://shs.hal.science/halshs-04591569/file/2023-317v4.pdf BibTex
titre
Interactions between sediment characteristics and oxygen conditions at the sediment-water interface of reservoirs: influences on nutrient dynamics and eutrophication Authors
auteur
Florian Mermillod-Blondin, Edwige Gautreau, Lucie Pinasseau, Emma Gouze, Félix Vallier, Laurence Volatier, Géraldine Nogaro
article
Hydrobiologia, In press, ⟨10.1007/s10750-024-05508-3⟩
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https://hal.science/hal-04560690/file/Mermillod-Blondin_et_al_preprint.pdf BibTex
titre
Warming drives feedback between plant phenotypes and ecosystem functioning in sub-Antarctic ponds
auteur
Pauline Douce, Laurent Simon, Fanny Colas, Florian Mermillod-Blondin, D Renault, Cécile Sulmon, Pauline Eymar-Dauphin, Roman Dubreucque, Anne-Kristel Bittebiere
article
Science of the Total Environment, 2024, Science of the Total Environment, 914, pp.169504. ⟨10.1016/j.scitotenv.2023.169504⟩
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https://hal.science/hal-04382961/file/1_Manuscript_R2.pdf BibTex
titre
Réduction des oxydes de fer, déstockage du carbone des sols noyés, et émission de méthane par un réservoir tropical
auteur
Étienne Dambrine, J. Gaillard, V. Chanudet, R. Vigouroux, Olivier Atteia, G. van der Heijden, Fanny Colas
article
Étude et Gestion des Sols, 2024, 31, pp.141-159
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https://hal.science/hal-04744084/file/Dambrine2024.pdf BibTex
titre
Trophic differentiation between the endemic Cypriot mouse and the house mouse: a study coupling stable isotopes and morphometrics
auteur
Sabrina Renaud, Emilie Hardouin, Eleftherios Hadjisterkotis, George Mitsainas, Maï Bergmann, Eloïse François, François Fourel, Laurent Simon
article
Journal of Mammalian Evolution, 2024, 31 (4), pp.44. ⟨10.1007/s10914-024-09740-5⟩
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https://hal.science/hal-04877814/file/Cyprus_isomorpho_V4b_final_complete.pdf BibTex