2025

Article dans une revue

titre

Counting the Invisible: New Tools to Estimate the Number of Contributors From Sequence‐Based Microsatellite Genotyping of Environmental DNA Samples

auteur

Olivier Lepais, Ivan Paz‐vinas

article

Molecular Ecology Resources, 2025, ⟨10.1111/1755-0998.70051⟩

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titre

Restoring genetic diversity to facilitate the implementation of the EU Nature Restoration Law

auteur

David O'Brien, Tsipe Aavik, Ancuta Fedorca, Martin C Fischer, Robin Goffaux, Sean Hoban, Peter Hollingsworth, Christina Hvilsom, Robert Jehle, Belma Kalamujić Stroil, Francine Kershaw, Peter Klinga, Alexander Kopatz, Deborah M Leigh, Ivan Paz-Vinas, Marine Robuchon, Gernot Segelbacher, Viktoria Takacs, Cristiano Vernesi, Linda Laikre

article

Biological Conservation, 2025, 303, pp.110995. ⟨10.1016/j.biocon.2025.110995⟩

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titre

How can biodiversity strategy and action plans incorporate genetic diversity and align with global commitments?

auteur

Sean Hoban, Christina Hvilsom, Abdeldjalil Aissi, Alexandre Aleixo, Julie Bélanger, Katarzyna Biala, Robert Ekblom, Ancuta Fedorca, W Chris Funk, Alejandra Lorena Goncalves, Andrew Gonzalez, Myriam Heuertz, Alice Hughes, Fumiko Ishihama, Belma Kalamujic Stroil, Linda Laikre, Philip Mcgowan, Katie Millette, David O'Brien, Ivan Paz-Vinas, Victor Julio Rincón-Parra, Marine Robuchon, Jon Paul Rodríguez, María Alejandra Rodríguez-Morales, Gernot Segelbacher, Tiffany Straza, Ruliyana Susanti, Ntakadzeni Tshidada, Sibelle Torres Vilaça, Jessica da Silva

article

Bioscience, 2025, 75, pp.47-60. ⟨10.1093/biosci/biae106⟩

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2024

Article dans une revue

titre

Dealing With the Complexity of Effective Population Size in Conservation Practice

auteur

Ancuta Fedorca, Joachim Mergeay, Adejoke O Akinyele, Tamer Albayrak, Iris Biebach, Alice Brambilla, Pamela A Burger, Elena Buzan, Ino Curik, Roberta Gargiulo, José A Godoy, Santiago C González‐martínez, Christine Grossen, Myriam Heuertz, Sean Hoban, Jo Howard‐mccombe, Maria Kachamakova, Peter Peter Klinga, Viktoria Köppä, Elenora Neugebauer, Ivan Paz‐vinas, Peter B Pearman, Laia Pérez‐sorribes, Baruch Rinkevich, Isa‐rita M Russo, Adélaïde Theraroz, Nia E Thomas, Marjana Westergren, Sven Winter, Linda Laikre, Alexander Kopatz

article

Evolutionary Applications, 2024, 17 (12), pp.e70031. ⟨10.1111/eva.70031⟩

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titre

Correction: DNA-based studies and genetic diversity indicator assessments are complementary approaches to conserving evolutionary potential

auteur

Sean Hoban, Ivan Paz-Vinas, Robyn Shaw, Luis Castillo-Reina, Jessica da Silva, J. Andrew Dewoody, Robert Ekblom, Ancuta Fedorca, Brenna Forester, W. Chris Funk, Julia Geue, Myriam Heuertz, Peter Hollingsworth, Alice Hughes, Margaret Hunter, Christina Hvilsom, Fumiko Ishihama, Rebecca Jordan, Belma Kalamujić Stroil, Francine Kershaw, Colin Khoury, Viktoria Köppä, Linda Laikre, Anna Macdonald, Alicia Mastretta-Yanes, Mariah Meek, Joachim Mergeay, Katie Millette, David O’brien, Victor Rincón-Parra, M. Alejandra Rodríguez-Morales, Meredith Schuman, Gernot Segelbacher, Paul Sunnucks, Rebecca Taylor, Henrik Thurfjell, Cristiano Vernesi, Catherine Grueber

article

Conservation Genetics, 2024, 25 (6), pp.1155-1157. ⟨10.1007/s10592-024-01642-6⟩

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titre

DNA-based studies and genetic diversity indicator assessments are complementary approaches to conserving evolutionary potential

auteur

Sean Hoban, Ivan Paz-Vinas, Robyn E Shaw, Luis Castillo-Reina, Jessica M D A Silva, J. Andrew Dewoody, Robert Ekblom, Ancuta Fedorca, Brenna R Forester, W. Chris Funk, Julia C Geue, Myriam Heuertz, Peter M Hollingsworth, Alice C Hughes, Margaret E Hunter, Christina Hvilsom, Fumiko Ishihama, Rebecca Jordan, Belma Kalamujić Stroil, Francine Kershaw, Colin K Khoury, Viktoria Köppä, Linda Laikre, Anna J Macdonald, Alicia Mastretta-Yanes, Mariah H Meek, Joachim Mergeay, Katie L Millette, David O’brien, Victor J Rincón-Parra, M. Alejandra Rodríguez-Morales, Meredith C Schuman, Gernot Segelbacher, Paul Sunnucks, Rebecca S Taylor, Henrik Thurfjell, Cristiano Vernesi, Catherine E Grueber

article

Conservation Genetics, 2024, 25, pp.1147-1153. ⟨10.1007/s10592-024-01632-8⟩

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titre

Guideline Materials and Documentation for the Genetic Diversity Indicators of the Monitoring Framework for the Kunming-Montreal Global Biodiversity Framework

auteur

Alicia Mastretta-Yanes, Sofía Suárez, Rebecca Jordan, Sean Hoban, Jessica da Silva, Luis Castillo-Reina, Myriam Heuertz, Fumiko Ishihama, Viktoria Köppä, Linda Laikre, Anna Macdonald, Joachim Mergeay, Ivan Paz-Vinas, Gernot Segelbacher, Alicia Knapps, Henry Rakoczy, Amelie Weiler, Angelica Atsaves, Kira Cullmann, Simone Bagnato, Brenna Forester

article

Biodiversity Informatics, 2024, 18, ⟨10.17161/bi.v18i.22332⟩

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titre

Best practices for genetic and genomic data archiving

auteur

Deborah Leigh, Amy Vandergast, Margaret Hunter, Eric Crandall, W. Chris Funk, Colin Garroway, Sean Hoban, Sara Oyler-Mccance, Christian Rellstab, Gernot Segelbacher, Chloé Schmidt, Ella Vázquez-Domínguez, Ivan Paz-Vinas

article

Nature Ecology & Evolution, 2024, 8, pp.1224-1232. ⟨10.1038/s41559-024-02423-7⟩

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titre

Estimation of contemporary effective population size in plant populations: Limitations of genomic datasets

auteur

Roberta Gargiulo, Véronique Decroocq, Santiago C. Gonzalez-Martinez, Ivan Paz‐vinas, Jean‐marc Aury, Isabelle Lesur Kupin, Christophe Plomion, Sylvain Schmitt, Ivan Scotti, Myriam Heuertz

article

Evolutionary Applications, 2024, 17 (5), ⟨10.1111/eva.13691⟩

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titre

Too simple, too complex, or just right? Advantages, challenges, and guidance for indicators of genetic diversity

auteur

Sean Hoban, Jessica da Silva, Alice Hughes, Margaret Hunter, Belma Kalamujić Stroil, Linda Laikre, Alicia Mastretta-Yanes, Katie Millette, Ivan Paz-Vinas, Lucia Ruiz Bustos, Robyn Shaw, Cristiano Vernesi, Chris Funk, Catherine Grueber, Francine Kershaw, Anna Macdonald, Mariah Meek, Cinnamon Mittan, David O'Brien, Rob Ogden, Gernot Segelbacher

article

Bioscience, 2024, 74 (4), pp.269-280. ⟨10.1093/biosci/biae006⟩

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titre

Multinational evaluation of genetic diversity indicators for the Kunming‐Montreal Global Biodiversity Framework

auteur

Alicia Mastretta‐yanes, Jessica M da Silva, Catherine E Grueber, Luis Castillo‐reina, Viktoria Köppä, Brenna R Forester, W. Chris Funk, Myriam Heuertz, Fumiko Ishihama, Rebecca Jordan, Joachim Mergeay, Ivan Paz‐vinas, Victor Julio Rincon‐parra, Maria Alejandra Rodriguez‐morales, Libertad Arredondo‐amezcua, Gaëlle Brahy, Matt Desaix, Lily Durkee, Ashley Hamilton, Margaret E Hunter, Austin Koontz, Iris Lang, María Camila Latorre‐cárdenas, Tanya Latty, Alexander Llanes‐quevedo, Anna J Macdonald, Meg Mahoney, Caitlin Miller, Juan Francisco Ornelas, Santiago Ramírez‐barahona, Erica Robertson, Isa‐rita M Russo, Metztli Arcila Santiago, Robyn E Shaw, Glenn M Shea, Per Sjögren‐gulve, Emma Suzuki Spence, Taylor Stack, Sofía Suárez, Akio Takenaka, Henrik Thurfjell, Sheela Turbek, Marlien van der Merwe, Fleur Visser, Ana Wegier, Georgina Wood, Eugenia Zarza, Linda Laikre, Sean Hoban

article

Ecology Letters, 2024, 27 (7), pp.e14461. ⟨10.1111/ele.14461⟩

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2023

Article dans une revue

titre

Monitoring status and trends in genetic diversity for the Convention on Biological Diversity: An ongoing assessment of genetic indicators in nine countries

auteur

Sean Hoban, Jessica M da Silva, Alicia Mastretta‐yanes, Catherine E Grueber, Myriam Heuertz, Margaret E Hunter, Joachim Mergeay, Ivan Paz‐vinas, Keiichi Fukaya, Fumiko Ishihama, Rebecca Jordan, Viktoria Köppä, María Camilla Latorre‐cárdenas, Anna J Macdonald, Victor Rincon‐parra, Per Sjögren‐gulve, Naoki Tani, Henrik Thurfjell, Linda Laikre

article

Conservation Letters, 2023, ⟨10.1111/conl.12953⟩

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titre

Patterns of genetic variation in native and non-native populations of European catfish Silurus glanis across Europe

auteur

Paul Castagné, Ivan Paz-Vinas, Stéphanie Boulêtreau, Jessica Ferriol, Géraldine Loot, Charlotte Veyssière, Robert Arlinghaus, Robert Britton, Marlène Chiarello, Emili García-Berthou, Pavel Horký, Delphine Nicolas, Annamaria Nocita, Oscar Nordahl, Michaël Ovidio, Filipe Ribeiro, Ondřej Slavík, Chloé Vagnon, Simon Blanchet, Frédéric Santoul

article

Biodiversity and Conservation, 2023, 32 (6), pp.2127-2147. ⟨10.1007/s10531-023-02596-w⟩

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titre

Genetic diversity goals and targets have improved, but remain insufficient for clear implementation of the post-2020 global biodiversity framework

auteur

Sean Hoban, Michael W Bruford, Jessica M da Silva, W. Chris Funk, Richard Frankham, Michael J Gill, Catherine E Grueber, Myriam Heuertz, Margaret E Hunter, Francine Kershaw, Robert C Lacy, Caroline Lees, Margarida Lopes-Fernandes, Anna J Macdonald, Alicia Mastretta-Yanes, Philip J K Mcgowan, Mariah H Meek, Joachim Mergeay, Katie L Millette, Cinnamon S Mittan-Moreau, Laetitia M Navarro, David O’brien, Rob Ogden, Gernot Segelbacher, Ivan Paz-Vinas, Cristiano Vernesi, Linda Laikre

article

Conservation Genetics, 2023, ⟨10.1007/s10592-022-01492-0⟩

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titre

Multiple lines and levels of evidence for avian zoochory promoting fish colonization of artificial lakes

auteur

Flavien Garcia, Ivan Paz-Vinas, Arnaud Gaujard, Julian D. Olden, Julien Cucherousset

article

Biology Letters, 2023, 19 (3), pp.20220533. ⟨10.1098/rsbl.2022.0533⟩

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titre

Genetic diversity and IUCN Red List status

auteur

Chloé Schmidt, Sean Hoban, Margaret Hunter, Ivan Paz-Vinas, Colin J. Garroway

article

Conservation Biology, 2023, 37 (4), pp.e14064. ⟨10.1111/cobi.14064⟩

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2022

Article dans une revue

titre

Promoting lab culture to enhance academic resilience during crises

auteur

Ignasi Arranz, Regina Nobre, Julien Cucherousset, Aline Reis de Carvalho, Amanda Cantarute-Rodrigues, Pierre Favriou, Flavien Garcia, Marie Gimenez, Alexis Imbert, Valentin Marin, Ivan Paz-Vinas

article

Ecology and Evolution, 2022, 12 (6), pp.e8986. ⟨10.1002/ece3.8986⟩

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titre

Global genetic diversity status and trends: towards a suite of Essential Biodiversity Variables (EBVs) for genetic composition

auteur

Sean Hoban, Frederick I. Archer, Laura D. Bertola, Jason G. Bragg, Martin F. Breed, Michael W. Bruford, Melinda A. Coleman, Robert Ekblom, W. Chris Funk, Catherine E. Grueber, Brian K. Hand, Rodolfo Jaffé, Evelyn Jensen, Jeremy S. Johnson, Francine Kershaw, Libby Liggins, Anna J. Macdonald, Joachim Mergeay, Joshua M. Miller, Frank Muller-Karger, David O'Brien, Ivan Paz-Vinas, Kevin M. Potter, Orly Razgour, Cristiano Vernesi, Margaret E. Hunter

article

Biological Reviews, 2022, 97 (4), pp.1511--1538. ⟨10.1111/brv.12852⟩

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2021

Article dans une revue

titre

Opportunities and challenges of macrogenetic studies

auteur

Deborah Leigh, Charles van Rees, Katie Millette, Martin Breed, Chloé Schmidt, Laura Bertola, Brian Hand, Margaret Hunter, Evelyn Jensen, Francine Kershaw, Libby Liggins, Gordon Luikart, Stéphanie Manel, Joachim Mergeay, Joshua Miller, Gernot Segelbacher, Sean Hoban, Ivan Paz-Vinas

article

Nature Reviews Genetics, 2021, 22 (12), pp.791-807. ⟨10.1038/s41576-021-00394-0⟩

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titre

Authors’ Reply to Letter to the Editor: Continued improvement to genetic diversity indicator for CBD

auteur

Linda Laikre, Paul A Hohenlohe, Fred W Allendorf, Laura D Bertola, Martin F Breed, Michael W Bruford, W. Chris Chris Funk, Gonzalo Gajardo, Antonio González-Rodríguez, Catherine E Grueber, Philip W Hedrick, Myriam Heuertz, Margaret E Hunter, Kerstin Johannesson, Libby Liggins, Anna J Macdonald, Joachim Mergeay, Farideh Moharrek, David O’brien, Rob Ogden, Pablo Orozco-Terwengel, Clarisse Palma-Silva, Jennifer Pierson, Ivan Paz-Vinas, Isa-Rita M Russo, Nils Ryman, Gernot Segelbacher, Per Sjögren-Gulve, Lisette P Waits, Cristiano Vernesi, Sean Hoban

article

Conservation Genetics, 2021, pp.1-4. ⟨10.1007/s10592-021-01359-w⟩

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titre

Effective population size remains a suitable, pragmatic indicator of genetic diversity for all species, including forest trees

auteur

Sean Hoban, Ivan Paz-Vinas, Sally Aitken, Laura Bertola, Martin Breed, Michael Bruford, W. Chris Funk, Catherine Grueber, Myriam Heuertz, Paul Hohenlohe, Margaret Hunter, Rodolfo Jaffé, Margarida Lopes Fernandes, Joachim Mergeay, Farideh Moharrek, David O'Brien, Gernot Segelbacher, Cristiano Vernesi, Lisette Waits, Linda Laikre

article

Biological Conservation, 2021, 253, pp.1-3. ⟨10.1016/j.biocon.2020.108906⟩

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titre

Inference of local invasion pathways in two invasive crayfish species displaying contrasting genetic patterns

auteur

Ivan Paz-Vinas, Iris Lang, Paul Millet, Charlotte Veyssière, Géraldine Loot, Julien Cucherousset

article

Journal of Applied Ecology, 2021, 58 (12), pp.2854--2865. ⟨10.1111/1365-2664.14023⟩

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titre

Patterns and determinants of phenotypic variability within two invasive crayfish species

auteur

Iris Lang, Ivan Paz-Vinas, Julien Cucherousset, Géraldine Loot

article

Freshwater Biology, 2021, 66 (9), pp.1782--1798. ⟨10.1111/fwb.13792⟩

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titre

Macrogenetic studies must not ignore limitations of genetic markers and scale

auteur

Ivan Paz‐vinas, Evelyn L. Jensen, Laura D. Bertola, Martin F. Breed, Brian K. Hand, Margaret E. Hunter, Francine Kershaw, Deborah M. Leigh, Gordon Luikart, Joachim Mergeay, Joshua M. Miller, Charles B. van Rees, Gernot Segelbacher, Sean Hoban

article

Ecology Letters, 2021, 24 (6), pp.1282--1284. ⟨10.1111/ele.13732⟩

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2020

Article dans une revue

titre

Genetic diversity targets and indicators in the CBD post-2020 Global Biodiversity Framework must be improved

auteur

Sean Hoban, Michael Bruford, Josephine d'Urban Jackson, Margarida Lopes-Fernandes, Myriam Heuertz, Paul A. Hohenlohe, Ivan Paz‐vinas, Per Sjögren-Gulve, Gernot Segelbacher, Cristiano Vernesi, Sally Aitken, Laura D. Bertola, Paulette Bloomer, Martin Breed, Hernando Rodríguez-Correa, W. Chris Funk, Catherine E. Grueber, Margaret E. Hunter, Rodolfo Jaffe, Libby Liggins, Joachim Mergeay, Farideh Moharrek, David O'Brien, Rob Ogden, Clarisse Palma-Silva, Jennifer Pierson, Uma Ramakrishnan, Murielle Simo-Droissart, Naoki Tani, Lisette Waits, Linda Laikre

article

Biological Conservation, 2020, 248, pp.1-11. ⟨10.1016/j.biocon.2020.108654⟩

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titre

A river runs through it: The causes, consequences, and management of intraspecific diversity in river networks

auteur

Simon Blanchet, Jérôme Prunier, Ivan Paz‐vinas, Keoni Saint-Pé, Olivier REY, Allan Raffard, Eglantine Mathieu-Bégné, Géraldine Loot, Lisa Fourtune, Vincent Dubut

article

Evolutionary Applications, 2020, 13 (6), pp.1195-1213. ⟨10.1111/eva.12941⟩

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2019

Article dans une revue

titre

Demographic and genetic collapses in spatially structured populations: insights from a long-term survey in wild fish metapopulations

auteur

Eglantine Mathieu-Bégné, Géraldine Loot, Mathieu Chevalier, Ivan Paz‐vinas, Simon Blanchet

article

Oikos, 2019, 128 (2), pp.196-207. ⟨10.1111/oik.05511⟩

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titre

Environmental conditions and neutral processes shape the skin microbiome of European catfish ( Silurus glanis ) populations of Southwestern France

auteur

Marlène Chiarello, Ivan Paz‐vinas, Charlotte Veyssière, Frédéric Santoul, Géraldine Loot, Jessica Ferriol, Stéphanie Boulêtreau

article

Environmental Microbiology Reports, 2019, 11 (4), pp.605--614. ⟨10.1111/1758-2229.12774⟩

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2018

Article dans une revue

titre

Systematic conservation planning for intraspecific genetic diversity

auteur

Ivan Paz-Vinas, Géraldine Loot, Virgilio Hermoso, Charlotte Veyssière, Nicolas Poulet, Gaêl Grenouillet, Simon Blanchet

article

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2018, 285 (1877), pp.2-10. ⟨10.1098/rspb.2017.2746⟩

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titre

Inferring Causalities in Landscape Genetics: An Extension of Wright’s Causal Modeling to Distance Matrices

auteur

Lisa Fourtune, Jérôme Prunier, Ivan Paz-Vinas, Géraldine Loot, Charlotte Veyssière, Simon Blanchet

article

The American Naturalist, 2018, 191 (4), pp.1-17. ⟨10.1086/696233⟩

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2016

Article dans une revue

titre

Lessons from the fish: a multi-species analysis reveals common processes underlying similar species-genetic diversity correlations

auteur

Lisa Fourtune, Ivan Paz-Vinas, Géraldine Loot, Jérôme Prunier, Simon Blanchet

article

Freshwater Biology, 2016, 61 (11), pp.1830--1845. ⟨10.1111/fwb.12826⟩

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2015

Article dans une revue

titre

Elucidating the spatio-temporal dynamics of an emerging wildlife pathogen using approximate Bayesian computation

auteur

Olivier REY, Lisa Fourtune, Ivan Paz-Vinas, Géraldine Loot, Charlotte Veyssiere, Benjamin Roche, Simon Blanchet

article

Molecular Ecology, 2015, 24 (21), pp.5348-5363. ⟨10.1111/mec.13401⟩

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titre

Evolutionary processes driving spatial patterns of intraspecific genetic diversity in river ecosystems

auteur

Ivan Paz-Vinas, Géraldine Loot, Virginie Marie Stevens, Simon Blanchet

article

Molecular Ecology, 2015, 24 (18), pp.4586-4604. ⟨10.1111/mec.13345⟩

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titre

Dendritic connectivity shapes spatial patterns of genetic diversity: a simulation-based study

auteur

Ivan Paz-Vinas, Simon Blanchet

article

Journal of Evolutionary Biology, 2015, 28 (4), pp.986-994. ⟨10.1111/jeb.12626⟩

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2013

Article dans une revue

titre

The demographic history of populations experiencing asymmetric gene flow: combining simulated and empirical data

auteur

I. Paz-Vinas, Erwan Quéméré, L. Chikhi, Géraldine Loot, Simon Blanchet

article

Molecular Ecology, 2013, 22 (12), pp.3279 - 3291. ⟨10.1111/mec.12321⟩

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