2025

Article dans une revue

titre

Diversity of Niphargus (Crustacea, Amphipoda) in France, as revealed by DNA barcoding approach

auteur

Behare Rexhepi, Teo Delić, Gaj Kušar, François Lefebvre, Thierry Alezine, Xavier Chevillot, Marie-José Olivier, Florian Malard, Christophe Douady, Fabio Stoch, Jacques Chauvin, Aurélie Husté, Matthieu Fournier, Maja Zagmajster, Cene Fišer

article

Zoosystematics and Evolution, 2025, 101 (4), pp.1831-1844. ⟨10.3897/zse.101.153239⟩

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titre

New Insights Into the Composition, Distribution and History of the Freshwater Isopod Species Complex Proasellus coxalis (Dollfus, 1892) in Europe and the Mediterranean Basin

auteur

Nathanaelle Saclier, Fabio Stoch, David Eme, Colin Issartel, Lara Konecny-Dupré, Christophe Douady, Florian Malard

article

Freshwater Biology, 2025, 70e70062 (6), ⟨10.1111/fwb.70062⟩

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titre

A Comprehensive Occurrence Dataset for European Ostracoda Inhabiting Groundwater and Groundwater‐Dependent Ecosystems

auteur

Nataša Mori, Živa Vehovar, Traian Brad, Gergely Balázs, Constanze Englisch, Cene Fišer, Santiago Gaviria, Sanja Gottstein, Christian Griebler, Marius Kenesz, Lee R F D Knight, Florian Malard, Stefano Mammola, Pierre Marmonier, Alejandro Martínez, Maja Zagmajster

article

Global Ecology and Biogeography, 2025, 34:e70065, ⟨10.1111/geb.70065⟩

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titre

Molecular basis for the calcium-dependent activation of the ribonuclease EndoU

auteur

Florian Malard, Kristen Dias, Margaux Baudy, Stéphane Thore, Brune Vialet, Philippe Barthélémy, Sébastien Fribourg, Fedor Karginov, Sébastien Campagne

article

Nature Communications, 2025, 16 (1), pp.3110. ⟨10.1038/s41467-025-58462-6⟩

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titre

Phylogenetic Origin of Morphologically Cryptic Species Shapes Co‐Occurrence and Sympatry Patterns

auteur

Teo Delić, Špela Di Batista Borko, Ester Premate, Behare Rexhepi, Roman Alther, Mara Knüsel, Florian Malard, Dieter Weber, Fabio Stoch, Jean‐françois Flot, Cene Fišer, Florian Altermatt

article

Freshwater Biology, 2025, 70e70000 (2), ⟨10.1111/fwb.70000⟩

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titre

EGCop : An Expert‐Curated Occurrence Dataset of European Groundwater‐Dwelling Copepods (Crustacea: Copepoda)

auteur

Francesco Cerasoli, Barbara Fiasca, Mattia Di Cicco, Emma Galmarini, Ilaria Vaccarelli, Stefano Mammola, Florian Malard, Fabio Stoch, Diana M P Galassi

article

Global Ecology and Biogeography, 2025, 34 (1), pp.e13953. ⟨10.1111/geb.13953⟩

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2024

Article dans une revue

titre

EU needs groundwater ecosystems guidelines

auteur

Tiziana Di Lorenzo, Enrico Lunghi, Cristina Aanei, Florian Altermatt, Roman Alther, Isabel Amorim, Raluca Băncilă, Adrià Bellvert, Anna Blomberg, Paulo Borges, Traian Brad, Anton Brancelj, David Brankovits, Pedro Cardoso, Francesco Cerasoli, Claire Chauveau, Luís Crespo, Michael Csader, Teo Delić, Mattia Di Cicco, Christophe Douady, Louis Duchemin, Arnaud Faille, Barbara Fiasca, Cene Fišer, Jean-Francois Flot, Rosalina Gabriel, Diana Galassi, Laura Garzoli, Christian Griebler, Clemens Karwautz, Marius Kenesz, Lara Konecny-Dupré, Thomas Lilley, Florian Malard, Alejandro Martínez, Melissa Meierhofer, Giuseppe Messana, Andrés Millán, Vangelis Mizerakis, Nataša Mori, Veronica Nanni, Giuseppe Nicolosi, Pedro Oromí, Susana Pallarés, Fernando Pereira, Ana Sofia P. S. Reboleira, Mattia Saccò, Alice Salussolia, David Sánchez-Fernández, Serban Sarbu, Andrei S̗tefan, Fabio Stoch, Agostina Tabilio Di Camillo, Stefano Taiti, Ilaria Vaccarelli, Valeria Valanne, Maja Zagmajster, Valerija Zakšek, Carina Zittra, Stefano Mammola

article

Science, 2024, 386 (6726), pp.1103-1103. ⟨10.1126/science.ads8140⟩

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titre

A second species of Stenasellus Dollfus, 1897 (Isopoda, Stenasellidae) from sulfidic groundwater of Iran described using morphological and molecular methods

auteur

Jure Jugovic, Mohammad Javad Malek-Hosseini, Colin Issartel, Lara Konecny-Dupré, Matjaž Kuntner, Yaser Fatemi, Jean-François Flot, Christophe Douady, Florian Malard

article

European Journal of Taxonomy, 2024, 968, ⟨10.5852/ejt.2024.968.2733⟩

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titre

The O-GlcNAc database: introducing new features and tools developed from community feedback

auteur

Florian Malard, Lilyanna Massman, Sébastien Campagne, Stephanie Olivier-van Stichelen

article

Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2024, ⟨10.1007/s00216-024-05571-8⟩

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titre

1H, 13C and 15N backbone resonance assignment of the calcium-activated EndoU endoribonuclease

auteur

Florian Malard, Fedor Karginov, Sébastien Campagne

article

Biomolecular NMR Assignments, 2024, 18 (2), pp.263-267. ⟨10.1007/s12104-024-10198-y⟩

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titre

The diversity of splicing modifiers acting on A -1 bulged 5 -splice sites reveals rules for rational drug design

auteur

Florian Malard, Antje C Wolter, Julien Marquevielle, Estelle Morvan, Agathe Ecoutin, Simon H Rüdisser, Frédéric H T Allain, Sebastien Campagne

article

Nucleic Acids Research, 2024, 52 (8), pp.4124-4136. ⟨10.1093/nar/⟩

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titre

A collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean evolution: The World Asellidae database

auteur

Nathanaelle Saclier, Louis Duchemin, Lara Konecny-Dupré, Philippe Grison, David Eme, Chloé Martin, Cécile Callou, Tristan Lefébure, Clémentine François, Colin Issartel, Julian Lewis, Fabio Stoch, Boris Sket, Sanja Gottstein, Teo Delić, Maja Zagmajster, Michal Grabowski, Dieter Weber, Ana Sofia P. S. Reboleira, Dmitry Palatov, Kaloust Paragamian, Lee Knight, Georges Michel, Francois Lefebvre, Mohammad‐javad Malek Hosseini, Ana Camacho, Begoña Gartzia de Bikuña, Amina Taleb, Nouria Belaidi, Raoul Tuekam Kayo, Diana Maria Paola Galassi, Oana Teodora Moldovan, Christophe Douady, Florian Malard

article

Molecular Ecology Resources, 2024, 24 (1), ⟨10.1111/1755-0998.13882⟩

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2023

Article dans une revue

titre

Molecular basis of RNA-binding and autoregulation by the cancer-associated splicing factor RBM39

auteur

Sébastien Campagne, Daniel Jutzi, Florian Malard, Maja Matoga, Ksenija Romane, Miki Feldmuller, Martino Colombo, Marc-David Ruepp, Null- T Allain

article

Nature Communications, 2023, 14, ⟨10.1038/s41467-023-40254-5⟩

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titre

Structural transitions in TCTP tumor protein upon binding to the anti-apoptotic protein family member Mcl-1

auteur

Florian Malard, Christina Sizun, Aurélien Thureau, Ludovic Carlier, Ewen Lescop

article

Journal of Biological Chemistry, 2023, 299 (7), pp.104830. ⟨10.1016/j.jbc.2023.104830⟩

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2022

Article dans une revue

titre

lnventai·re des especes souterraines dans l'ere moleculaire

auteur

Florian Malard, Héloïse Verdier, Lara Konecny-Dupré, David Eme, Christophe J Douady, Tristan Lefébure

article

Karstologia, 2022

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titre

Principles and correction of 5’-splice site selection

auteur

Florian Malard, Cameron D Mackereth, Sébastien Campagne

article

RNA Biology, 2022, 19, pp.943 - 960. ⟨10.1080/15476286.2022.2100971⟩

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titre

EpyNN: Educational python for Neural Networks

auteur

Florian Malard, Laura Danner, Emilie Rouzies, Jesse Meyer, Ewen Lescop, Stéphanie Olivier-van Stichelen

article

SoftwareX, 2022, 19, pp.101140. ⟨10.1016/j.softx.2022.101140⟩

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titre

Unique and shared effects of local and catchment predictors over distribution of hyporheic organisms: does the valley rule the stream?

auteur

Samuel Mouron, David Eme, Arnaud Bellec, Mélanie Bertrand, Stefano Mammola, Frédéric Liébault, Christophe J Douady, Florian Malard

article

Ecography, 2022, 2022 (5), pp.e06099. ⟨10.1111/ecog.06099⟩

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titre

Revisiting the molecular interactions between the tumor protein TCTP and the drugs sertraline/thioridazine.

auteur

Florian Malard, Eric Jacquet, Naima Nhiri, Christina Sizun, Amélie Chabrier, Samir Messaoudi, Jérôme Dejeu, Stéphane Betzi, Xu Zhang, Aurélien Thureau, Ewen Lescop

article

ChemMedChem, 2022, 17 (1), pp.e202100528. ⟨10.1002/cmdc.202100528⟩

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titre

A new obligate groundwater species of Asellus (Isopoda, Asellidae) from Iran

auteur

Mohammad Javad Malek-Hosseini, Jure Jugovic, Yaser Fatemi, Matjaž Kuntner, Rok Kostanjšek, Christophe Douady, Florian Malard

article

Subterranean Biology, 2022, 42, pp.97-124. ⟨10.3897/subtbiol.42.79447⟩

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2021

Article dans une revue

titre

Cave amphipods reveal co‐variation between morphology and trophic niche in a low‐productivity environment

auteur

Ester Premate, Špela Borko, Teo Delić, Florian Malard, Laurent Simon, Cene Fišer

article

Freshwater Biology, 2021, 66 (10), pp.1876-1888. ⟨10.1111/fwb.13797⟩

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titre

An in vitro reconstituted U1 snRNP allows the study of the disordered regions of the particle and the interactions with proteins and ligands

auteur

Sébastien Campagne, Tebbe de Vries, Florian Malard, Pavel Afanasyev, Georg Dorn, Emil Dedic, Joachim Kohlbrecher, Daniel Boehringer, Antoine Cléry, Frédéric H-T Allain

article

Nucleic Acids Research, 2021, 49 (11), pp.e63-e63. ⟨10.1093/nar/gkab135⟩

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titre

Drimane derivatives as the first examples of covalent BH3-mimetics that target MCL-1

auteur

Florian Daressy, Florian Malard, Line Seguy, Vincent Guérineau, Cécile Apel, Vincent Dumontet, Aude Robert, Anne‐claire Groo, Marc Litaudon, Jérôme Bignon, Sandy Desrat, Aurélie Malzert-Fréon, Joëlle Wiels, Ewen Lescop, Fanny Roussi

article

ChemMedChem, 2021, 16 (11), pp.1789-1798. ⟨10.1002/cmdc.202100011⟩

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2020

Article dans une revue

titre

Fundamental research questions in subterranean biology

auteur

Stefano Mammola, Isabel Amorim, Maria Bichuette, Paulo Borges, Naowarat Cheeptham, Steven Cooper, David Culver, Louis Deharveng, David Eme, Rodrigo Lopes Ferreira, Cene Fišer, Žiga Fišer, Daniel Fong, Christian Griebler, William Jeffery, Jure Jugovic, Johanna Kowalko, Thomas Lilley, Florian Malard, Raoul Manenti, Alejandro Martínez, Melissa Meierhofer, Matthew Niemiller, Diana Northup, Thais Pellegrini, Tanja Pipan, Meredith Protas, Ana Sofia P. S. Reboleira, Michael Venarsky, J. Judson Wynne, Maja Zagmajster, Pedro Cardoso

article

Biological Reviews, 2020, 95 (6), pp.1855-1872. ⟨10.1111/brv.12642⟩

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titre

Bedrock radioactivity influences the rate and spectrum of mutation

auteur

Nathanaëlle Saclier, Patrick Chardon, Florian Malard, Lara Konecny-Dupré, David Eme, Arnaud Bellec, Vincent Breton, Laurent Duret, Tristan Lefébure, Christophe Jean Douady

article

eLife, 2020, 9, pp.e56830. ⟨10.7554/eLife.56830⟩

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titre

Trophic selectivity in aquatic isopods increases with the availability of resources

auteur

Clémentine François, Laurent Simon, Florian Malard, Tristan Lefébure, Christophe Jean Douady, Florian Mermillod-Blondin

article

Functional Ecology, 2020, 34, pp.1078-1090. ⟨10.1111/1365-2435.13530⟩

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titre

GOTIT: A laboratory application software for optimizing multi‐criteria species‐based research

auteur

Florian Malard, Philippe Grison, Louis Duchemin, Lara Konecny-Dupré, Tristan Lefébure, Nathanaëlle Saclier, David Eme, Chloé Martin, Cécile Callou, Christophe Jean Douady

article

Methods in Ecology and Evolution, 2020, 11, pp.159-167. ⟨10.1111/2041-210X.13307⟩

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2019

Article dans une revue

titre

Extending Janzen’s hypothesis to temperate regions: A test using subterranean ecosystems

auteur

Stefano Mammola, Elena Piano, Florian Malard, Philippe Vernon, Marco Isaia

article

Functional Ecology, 2019, 33 (9), pp.1638-1650. ⟨10.1111/1365-2435.13382⟩

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titre

Scientists' Warning on the Conservation of Subterranean Ecosystems

auteur

Stefano Mammola, Pedro Cardoso, David Culver, Louis Deharveng, Rodrigo Ferreira, Cene Fišer, Diana Galassi, Christian Griebler, Stuart Halse, William Humphreys, Marco Isaia, Florian Malard, Alejandro Martínez, Oana Moldovan, Matthew Niemiller, Martina Pavlek, Ana Sofia P S Reboleira, Marconi Souza-Silva, Emma Teeling, J Judson Wynne, Maja Zagmajster

article

Bioscience, 2019, 69 (8), pp.641-50. ⟨10.1093/biosci/biz064⟩

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2018

Article dans une revue

titre

Life History Traits Impact the Nuclear Rate of Substitution but Not the Mitochondrial Rate in Isopods

auteur

Nathanaëlle Saclier, Clémentine François, Lara Konecny-Dupré, Nicolas Lartillot, Laurent Guéguen, L. Duret, Florian Malard, Christophe Jean Douady, Tristan Lefébure

article

Molecular Biology and Evolution, 2018, 35 (12), pp.2900-2912. ⟨10.1093/molbev/msy184⟩

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titre

Conformational Ensemble and Biological Role of the TCTP Intrinsically Disordered Region: Influence of Calcium and Phosphorylation

auteur

Florian Malard, Nadine Assrir, Mouad Alami, Samir Messaoudi, Ewen Lescop, Tâp Ha-Duong

article

Journal of Molecular Biology, 2018, 430 (11), pp.1621-1639. ⟨10.1016/j.jmb.2018.04.024⟩

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titre

Do cryptic species matter in macroecology? Sequencing European groundwater crustaceans yields smaller ranges but does not challenge biodiversity determinants

auteur

David Eme, Maja Zagmajster, Teo Delić, Cene Fišer, Jean-François Flot, Lara Konecny-Dupré, Snaebjörn Pálsson, Fabio Stoch, Valerija Zakšek, Christophe Jean Douady, Florian Malard

article

Ecography, 2018, 41 (2), pp.424 - 436. ⟨10.1111/ecog.02683⟩

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titre

Cryptic species as a window into the paradigm shift of the species concept

auteur

Cene Fišer, Christopher Robinson, Florian Malard

article

Molecular Ecology, 2018, 27 (3), pp.613 - 635. ⟨10.1111/mec.14486⟩

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2017

Article dans une revue

titre

Geomorphic influence on intraspecific genetic differentiation and diversity along hyporheic corridors

auteur

Florian Malard, Cécile Capderrey, Benjamin Churcheward, David Eme, Bernard Kaufmann, Lara Konecny-Dupré, Jean-Paul Léna, Frédéric Liébault, Christophe Jean Douady

article

Freshwater Biology, 2017, 62 (12), pp.1955 - 1970. ⟨10.1111/fwb.13040⟩

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titre

Less effective selection leads to larger genomes

auteur

Tristan Lefébure, Claire Morvan, Florian Malard, Clémentine François, Lara Konecny-Dupré, Laurent Guéguen, Michèle Weiss-Gayet, Andaine Seguin-Orlando, Luca Ermini, Clio Der Sarkissian, N. Pierre Charrier, David Eme, Florian Mermillod-Blondin, L. Duret, Cristina Vieira, Ludovic Orlando, Christophe Jean Douady

article

Genome Research, 2017, 27, pp.1016-1028. ⟨10.1101/gr.212589.116⟩

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2016

Article dans une revue

titre

Disentangling the effects of land use and geo-climatic factors on diversity in European freshwater ecosystems

auteur

Christian K. Feld, Sebastian Birk, David Eme, Michael Gerisch, Daniel Hering, Martin Kernan, Kairi Maileht, Ute Mischke, Ingmar Ott, Florian Pletterbauer, Sandra Poikane, Jorge Salgado, Carl Sayer, Jeroen van Wichelen, Florian Malard

article

Ecological Indicators, 2016, 60, pp.71 - 83. ⟨10.1016/j.ecolind.2015.06.024⟩

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titre

Trophic ecology of groundwater species reveals specialization in a low-productivity environment

auteur

Clémentine François, Florian Mermillod-Blondin, Florian Malard, François Fourel, Christophe Lecuyer, Christophe Jean Douady, Laurent Simon

article

Functional Ecology, 2016, 30, pp.262-273. ⟨10.1111/1365-2435.12484⟩

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titre

No Evidence That Nitrogen Limitation Influences the Elemental Composition of Isopod Transcriptomes and Proteomes

auteur

Clémentine François, L. Duret, Laurent Simon, Florian Mermillod-Blondin, Florian Malard, Lara Konecny-Dupré, Rémi Planel, Simon Penel, Christophe Jean Douady, Tristan Lefébure

article

Molecular Biology and Evolution, 2016, 33 (10), pp.2605-2620. ⟨10.1093/molbev/msw131⟩

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2015

Article dans une revue

titre

Biodiversity in mountain groundwater: the Mercantour National Park (France) as a European hotspot

auteur

Marie-José Dole-Olivier, Diana M.P. Galassi, Frank Fiers, Florian Malard, Patrick Martin, Dominique P. Martin, Pierre Marmonier

article

Zoosystema, 2015, 37 (4), pp.529-550. ⟨10.5252/z2015n4a1⟩

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titre

Multi-causality and spatial non-stationarity in the determinants of groundwater crustacean diversity in Europe

auteur

David Eme, Maja Zagmajster, Cene Fiser, Diana M.P. Galassi, Pierre Marmonier, Fabio Stoch, Jean François Cornu, Thierry Oberdorff, Florian Malard

article

Ecography, 2015, 38, pp.531-540. ⟨10.1111/ecog.01092⟩

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2014

Article dans une revue

titre

Current developments in groundwater ecology -- from biodiversity to ecosystem function and services

auteur

Christian Griebler, Florian Malard, Tristan Lefébure

article

Current Opinion in Biotechnology, 2014, 27, pp.159-167. ⟨10.1016/j.copbio.2014.01.018⟩

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titre

Geographic variation in range size and beta diversity of groundwater crustaceans: insights from habitats with low thermal seasonality

auteur

M. Zagmajster, David Eme, Cene Fiser, Diana M.P. Galassi, Pierre Marmonier, Fabio Stoch, Jean-François Cornu, Florian Malard

article

Global Ecology and Biogeography, 2014, 23 (10), pp.1135-1145. ⟨10.1111/Geb.12200⟩

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titre

Integrating phylogeography, physiology, and habitat modelling to explore species range déterminants

auteur

David Eme, Florian Malard, Céline Colson-Proch, Pauline Jean, Sébastien Calvignac, Lara Konecny-Dupré, Frédéric Hervant, Christophe Jean Douady

article

Journal of Biogeography, 2014, 41, pp.687-699. ⟨10.1111/jbi.12237⟩

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2013

Article dans une revue

titre

Invertebrate distribution across nested geomorphic features in braided-river landscapes

auteur

Cécile Capderrey, T. Datry, Arnaud Foulquier, Cécile Claret, Florian Malard

article

Freshwater Science, 2013, 32 (4), pp.1188-1204. ⟨10.1899/12-188.1⟩

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titre

Thermal tolerance breadths among groundwater crustaceans living in a thermally constant environment

auteur

Florian Mermillod-Blondin, C. Lefour, Lisa Lalouette, David Renault, Florian Malard, Laurent Simon, Christophe Jean Douady

article

Journal of Experimental Biology, 2013, 216 (9), pp.1683-94. ⟨10.1242/jeb.081232⟩

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titre

Timetree of aselloidea reveals species diversification dynamics in groundwater

auteur

Claire Morvan, Florian Malard, Emmanuel Paradis, Tristan Lefébure, Lara Konecny-Dupré, Christophe Jean Douady

article

Systematic Biology, 2013, 62 (4), pp.512-22. ⟨10.1093/sysbio/syt015⟩

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titre

The distribution of groundwater habitats in Europe

auteur

Jean-François Cornu, David Eme, Florian Malard

article

Hydrogeology Journal, 2013, 21 (5), pp.949-960. ⟨10.1007/s10040-013-0984-1⟩

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titre

Microsatellite Development and First Population Size Estimates for the Groundwater Isopod Proasellus walteri

auteur

Cécile Capderrey, Bernard Kaufmann, Pauline Jean, Florian Malard, Lara Konecny-Dupré, Tristan Lefébure, Christophe Jean Douady

article

PLoS ONE, 2013, 8 - e76213 (9), pp.1-10. ⟨10.1371/journal.pone.0076213⟩

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titre

Bayesian phylogeographic inferences reveal contrasting colonization dynamics among European groundwater isopods

auteur

David Eme, Florian Malard, Lara Konecny-Dupré, Tristan Lefébure, Christophe Jean Douady

article

Molecular Ecology, 2013, 22, pp.5685-5699. ⟨10.1111/mec.12520⟩

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2011

Article dans une revue

titre

Surface water linkages regulate trophic interactions in a groundwater food web

auteur

Arnaud Foulquier, Florian Malard, Florian Mermillod-Blondin, Bernard Montuelle, Sylvain Dolédec, Bernadette Volat, Janine Gibert

article

Ecosystems, 2011, 14 (8), pp.1339-1353. ⟨10.1007/s10021-011-9484-0⟩

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