benjamin.monod-broca@univ-lyon1.fr
E2C
Doctorant UCBL
Doctorant UCBL
L’anthropisation est la première cause du déclin de la biodiversité à l’échelle mondiale. Face à cette pression, une large majorité d’espèces sont incapables de se maintenir et disparaissent, mais certaines parviennent à s’accommoder d’habitats anthropisés et maintiennent des populations stables. C'est le cas du Sonneur à ventre jaune (Bombina variegata), qui occupe à la fois des habitats naturels — situés en périphérie de systèmes rivulaires — et des habitats anthropisés tels que les forêts exploitées, les carrières, les prairies pâturées, ou encore les zones agricoles. De précédentes analyses ont montré que cette espèce compense la surmortalité induite par les activités humaines par un recrutement plus élevé, menant à un rythme de vie plus rapide en contexte anthropisé. Dans le prolongement de ces résultats, mon travail de thèse vise à mieux comprendre les liens entre anthropisation, biodémographie et génétique, en tirant partie d'un large échantillonnage de capture-marquage-recapture et génomique en Europe de l'Ouest (France et Allemagne). En particulier, j'étudie la génétique du paysage pour comprendre quelles conditions environnementales favorisent la diversité génétique et les flux de gènes entre populations à l'échelle régionale. J'examine également les potentielles bases génomiques sous-tendant l'adaptation aux habitats anthropisés, ainsi que les liens entre temps de génération et diversité génétique.
Anthropization is the leading cause of biodiversity decline worldwide. Faced with this pressure, a large majority of species are unable to survive and disappear, but some manage to adapt to anthropized habitats and maintain stable populations. This is the case for the yellow-bellied toad (Bombina variegata), which occupies both natural habitats—located on the outskirts of river systems—and anthropized habitats such as logged forests, quarries, grazed meadows, and agricultural areas. Previous analyses have shown that this species compensates for the excess mortality induced by human activities through higher recruitment, leading to a faster life history in anthropized contexts. Building on these results, my thesis work aims to better understand the links between anthropization, biodemography, and genetics, drawing on a large sample of capture-mark-recapture and genomic data from Western Europe (France and Germany). In particular, I study landscape genetics to understand which environmental conditions promote genetic diversity and gene flow between populations at the regional scale. I also examine the potential genomic bases underlying adaptation to anthropized habitats, as well as the links between generation time and genetic diversity.
2025
Article dans une revue
- titre
- Historical biogeography and systematics of yellow-bellied toads (Bombina variegata), with the description of a new subspecies from the Balkans
- auteur
- Christophe Dufresnes, Simeon Lukanov, Sven Gippner, Johanna Ambu, Ilias Strachinis, Dragan Arsovski, Benjamin Monod-Broca, Hugo Cayuela, Petros Lymberakis, Daniele Canestrelli, Dan Cogălniceanu, Nikolay A Poyarkov, Spartak N Litvinchuk, Tomasz Suchan, Mathieu Denoël, Daniel Jablonski
- article
- Vertebrate Zoology, 2025, 75, pp.1-30. ⟨10.3897/vz.75.e138687⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
- titre
- Frankenstein matrices: Among‐population life history variation affects the reliability and predictions of demographic models
- auteur
- Giacomo Rosa, Benedikt Schmidt, Jean‐paul Léna, Benjamin Monod-Broca, Leonardo Vignoli, Emilie Tournier, Eric Bonnaire, Holger Buschmann, Thierry Kinet, Arnaud Laudelout, Remi Fonters, Carlo Biancardi, Anna Di Cerbo, Dominique Langlois, Jean‐marc Thirion, Lucy Morin, Julian Pichenot, Julien Moquet, Hugo Cayuela, Stefano Canessa
- article
- Journal of Animal Ecology, 2025, 94 (3), pp.436-448. ⟨10.1111/1365-2656.14243⟩
- Accès au bibtex
-
2024
Article dans une revue
- titre
- Piecing the barcoding puzzle of Palearctic water frogs ( Pelophylax ) sheds light on amphibian biogeography and global invasions
- auteur
- Christophe Dufresnes, Benjamin Monod‐broca, Adriana Bellati, Daniele Canestrelli, Johanna Ambu, Ben Wielstra, Sylvain Dubey, Pierre-André Crochet, Mathieu Denoël, Daniel Jablonski
- article
- Global Change Biology, 2024, 30 (3), pp.e17180. ⟨10.1111/gcb.17180⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
-
2022
Article dans une revue
- titre
- Compensatory recruitment allows amphibian population persistence in anthropogenic habitats
- auteur
- Hugo Cayuela, Benjamin Monod-Broca, Jean-François Lemaître Lemaître, Aurélien Besnard, Jérôme Gippet, Benedikt Schmidt, Antonio Romano, Thomas Hertach, Claudio Angelini, Stefano Canessa, Giacomo Rosa, Leonardo Vignoli, Alberto Venchi, Marco Carafa, Filippo Giachi, Andrea Tiberi, Alena Hantzschmann, Ulrich Sinsch, Emilie Tournier, Eric Bonnaire, Günter Gollmann, Birgit Gollmann, Annemarieke Spitzen-van der Sluijs, Holger Buschmann, Thierry Kinet, Arnaud Laudelout, Remi Fonters, Yoann Bunz, Marc Corail, Carlo Biancardi, Anna Di Cerbo, Dominique Langlois, Jean-Marc Thirion, Laurent Bernard, Elodie Boussiquault, Florian Doré, Titouan Leclerc, Nadine Enderlin, Florian Laurenceau, Lucy Morin, Mégane Skrzyniarz, Mickael Barrioz, Yohan Morizet, Sam Cruickshank, Julian Pichenot, Andreas Maletzky, Thibaut Delsinne, Dominik Henseler, Damien Aumaître, Miguel Gailledrat, Julien Moquet, Robert Veen, Peter Krijnen, Laurent Rivière, Matteo Trenti, Sonia Endrizzi, Paolo Pedrini, Marta Biaggini, Stefano Vanni, David Dudgeon, Jean-Michel Gaillard, Jean-Paul Léna
- article
- Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2022, 119 (38), pp.e2206805119. ⟨10.1073/pnas.2206805119⟩
- Accès au texte intégral et bibtex
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