UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés


  • 001
  • 002
  • 003
  • 004
  • 005
  • 006
  • 007
  • 008
  • 009
  • 010
  • 011
  • 012
  • 013
  • 014
  • 015
  • 016
  • 017
  • 018
  • 019
  • 020
  • 021
  • 022
  • 023
  • 024
logo LEHNA

UMR CNRS 5023

Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes
Naturels et Anthropisés

CLAVEL Julien
CR CNRS

Chercheur : P3E

Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex FRANCE

(+33) 04 72 44 84 24

Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.






  • Intérêts et activités de recherche

    Je suis un biologiste de l’évolution dont les recherches visent, dans leur ensemble, à comprendre les processus qui ont généré, maintenu, et ultimement éliminé la diversité biologique au cours du temps (macroévolution). Pour cela, j’utilise et développe des approches analytiques, quantitatives et comparatives [en particulier les méthodes comparatives phylogénétiques], pour mieux comprendre les conséquences sur l’évolution de la diversité taxinomique et phénotypique des interactions entre espèces, ainsi que leurs interactions avec leurs environnements.
    Mon approche modélisatrice est essentiellement développée autour de l’objet phylogénétique, qui me fournit le contexte historique mais aussi évolutif me permettant d’adresser des questions fondamentales en macroévolution. L’originalité de cette approche, est qu’elle offre un canevas analytique commun aux études sur des données d’espèces fossiles et actuelles. L’approche modélisatrice me permet également d’appréhender de manière unique des échelles de temps et d’espaces qu’il n’est possible d’analyser autrement de manière expérimentale.

    I'm an evolutionary biologist generally interested in the processes that generate, maintain, and ultimately eliminate biological diversity through time (macroevolution). To this aim, I’m using and developing comparative and quantitative analytical approaches [especially modelling and phylogenetic comparative methods] for understanding the evolutionary consequences on phenotypic and taxonomic diversity of species interactions and their interactions with their environments.
    The modelling approach I take is essentially developed on the phylogenetic framework which is providing the historical and evolutionary context needed to tackle long standing and fundamental questions in macroevolution. In particular, this modelling approach on phylogenies defines a unified analytical framework for the study of both extant and fossil data and allows assessing how species have evolved on spatial and temporal scales that are otherwise inaccessible to experimental biology.

  • 2021     Editeur Associé (AE) pour la revue Evolution

    2020    Chargé de Recherche CNRS dans l’UMR 5023
    – Université Claude Bernard Lyon 1

    2018 – 2020     Post-doctorat, The Natural History Museum, London. Marie Sklodowska-Curie fellow (projet EVOTOOLS IF797373)

    2014 – 2018     Post-doctorat, École Normale Supérieure (IBENS-UMR8197), Paris.

    2014    Thèse de doctorat - Université Claude Bernard Lyon 1 [spécialité : Paléoenvironnement et Évolution] ;
    Titre : « Ecomorphologie et Evolution phénotypique : méthodes et applications aux ruminants actuels et aux "ongulés" fossiles lors de la Crise de Salinité Messinienne à la limite Mio-Pliocène ». Directeurs de thèse : Dr. Gilles Escarguel et Dr. Gildas Merceron

    2010    Master en Paléontologie, Sédimentologie et Paléoenvironnements,
    Université Claude Bernard Lyon 1/ École Normale Supérieure de Lyon.

    2009    Master en Paléontologie, Phylogénie et Paléobiologie,
    Université des Sciences et Techniques du Languedoc Montpellier 2.

    2007    Licence en Sciences de la Terre et Environnement
    Université des Sciences et Techniques du Languedoc Montpellier 2.

  • 2021 Bardua, C., Fabre, A.-C., Clavel, J., Bon, M., Das, K., Stanley, E.L., Blackburn, D.C., Goswami, A. 2021 - Size, microhabitat, and loss of larval feeding drive cranial diversification in frogs. Nature Communications, 12:2503. (10.1038/s41467-021-22792-y)

    2021 Drury, J., Clavel, J., Tobias, J.A., Rolland, J., Sheard, C., Morlon, H., 2021 - Tempo and mode of morphological evolution are decoupled from latitude in birds. PLoS Biology, Public Library of Science, 2021, 19 (8), pp.e3001270. ⟨10.1371/journal.pbio.3001270⟩

    2021 Lafuma, F., Corfe, I., Clavel, J., Di-Poï, N., 2021 - Multiple evolutionary origins and losses of tooth complexity in squamates. Nature Communications, Nature Publishing Group, 12 (6001). ⟨10.1038/s41467-021-26285-w⟩

    2020 Clavel, J. Morlon, H., 2020 - Reliable phylogenetic regressions for multivariate comparative data: illustration with the MANOVA and application to the effect of diet on mandible morphology in phyllostomid bats. Systematic Biology, 69(5):927-943.


    2020 Coombs, E.J., Clavel, J., Park, T., Churchill, M., Goswami, A., 2020 - Wonky whales: the evolution of cranial asymmetry in cetaceans. BMC Biology 18(86): 1-24.

    2020 Fabre, A.C., Bardua, C., Bon, M., Clavel, J., Felice, R.N., Streicher, J.W., Bonnel, J., Stanley, E.D, Blackburn, D.C., Goswami, A., 2020 - Metamorphosis and the evolution of morphological diversity in salamanders. Nature Ecology and Evolution, 4(8):1129-1140.



    2020 Garcia, M., Theunissen, F., Sèbe, F., Clavel, J., Ravignani, A., Marin-Cudraz, T., Fuchs, J., Mathevon, N., 2020 - Evolution of communication signals and information during species radiation. Nature Communications, 11:4970.


    2020 Martinez, Q., Clavel, J., Esselstyn, J.A., Achmadi, A.S., Grohé, C., Pirot, N., Fabre P.H., 2020 - Convergent evolution of olfactory and thermoregulatory capacities in small amphibious mammals. Proceedings of the National Academy of Sciences, 117(16) : 8958-8965.

    2020 White, H.E., Clavel, J., Tucker, A.S., Goswami, A., 2020 - A comparison of metrics for quantifying cranial suture complexity. Journal of the Royal Society Interface, 17:20200476.


    2019
    Clavel, J., Aristide, L., Morlon, H., 2019 - A penalized likelihood framework for high-dimensional phylogenetic comparative methods and an application to New-World monkeys brain evolution. Systematic Biology, 68(1): 93-116.

    2018
    Gomes Rodrigues, H., Cornette, R., Clavel, J., Cassini, G., Bhullar, B.-A., Fernández-Monescillo, M., Moreno, K., Herrel, A., Billet, G., 2018 - Differential influences of allometry, phylogeny and environment on the vast rostral shape diversity of extinct South American notoungulates. Royal Society Open Science, 5(1): 171816.

    Joly, S., Lambert, F., Alexandre, H., Clavel, J., Léveillé-Bourret, E, Clark, J. L, 2018 - Increased pollination specialization did not increase corolla shape constraints in Antillean plants. Evolution, 72(2): 244-260.

    2017
    Clavel, J., Morlon, H., 2017 - Accelerated body size evolution during cold climatic periods in the Cenozoic. Proceedings of the National Academy of Sciences, 114(16): 4183-4188.

    2016
    Drury, J., Clavel, J., Manceau, M., Morlon, H., 2016 - Estimating the effect of competition on trait evolution using maximum likelihood inference. Systematic Biology, 65(4): 700-710.

    Morlon, H., Lewitus E., Condamine F. L., Manceau, M., Clavel, J., Drury, J., 2016 - RPANDA: an R package for macroevolutionary analyses on phylogenetic trees. Methods in Ecology and Evolution, 7(5): 589-597.

    2015
    Clavel, J., Escarguel, G., Merceron, G., 2015 - mvMORPH: an R package for fitting multivariate evolutionary models to morphometric data. Methods in Ecology and Evolution, 6(11): 1311-1319.

    2014
    Clavel, J., Merceron, G., Escarguel, G., 2014 - Missing data estimation in morphometrics: How much is too much? Systematic Biology, 63(2): 203-218.

    2012
    Clavel, J., Merceron, G., Hristova, L., Spassov, N., Kovatchev, D., Escarguel, G., 2012 - On Mesopithecus habitat: insights from late Miocene fossil vertebrate localities of Bulgaria. Journal of Human Evolution, 63: 162-179.

    2011
    Tabuce, R., Clavel, J., Antunes, M-T., 2011 - A structural intermediate between triisodontids and mesonychians (Mammalia, Acreodi) from the earliest Eocene of Portugal. Naturwissenschaften, 98(2): 145-155.

    2010
    Hautier, L., Clavel, J., Lazzari, V., Gomes Rodrigues, H., Vianey-Liaud, M., 2010 - Changes in the direction of mastication and relationships with the remodeling of the masticatory apparatus during mammalian evolution: the case of the Issiodoromyinae (Rodentia, Mammalia). Palaios 25(1): 6-13.


    Autres productions :

    Edition de logiciels :

    - R package mvMORPH “Multivariate comparative tools for fitting evolutionary models to morphometric data” (Auteur et créateur) accès libre en ligne sur le site du CRAN.
    (http://cran.r-project.org/web/packages/mvMORPH/).

    - R package RPANDA “Phylogenetic ANalysis of DiversificAtion. Implements macroevolutionary analyses on phylogenetic trees” (Auteur), accès libre en ligne sur le site du CRAN.
    (https://cran.r-project.org/web/packages/RPANDA/).

    - R package glassoFast “glassoFast: a Fast Graphical LASSO” (Mainteneur et contributeur) accès libre en ligne sur le site du CRAN.
    (https://cran.r-project.org/web/packages/glassoFast/).

Site de la Doua
Université Claude Bernard - Lyon I
CNRS, UMR 5023 - LEHNA (Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés)
3-6, rue Raphaël Dubois - Bâtiments Darwin C & Forel, 69622 Villeurbanne Cedex
43, Boulevard du 11 novembre 1918
Plan d'accès
Tél. : (33) 4 72 43 29 53 - Fax : (33) 4 72 43 11 41
Site de Vaulx-en-Velin
ENTPE
CNRS, UMR 5023 - LEHNA (Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés)
3, rue Maurice Audin
69518 Vaulx-en-Velin
Plan d'accès
Tél : (33) 04 72 04 70 56 - Fax : (33) 04 72 04 77 43