Ecologie Moléculaire
Responsable scientifique : Clémentine François
Référent technique : Lara Konecny
Adeline Dumet
Le plateau « Écologie Moléculaire » est dédié au développement et à la mise en œuvre de méthodes d’analyses des acides nucléiques (extraction, quantification, PCR, contrôles de qualité, préparation de librairies de séquençage Illumina…). Les projets supportés par ce plateau utilisent principalement des approches de séquençage ou de génotypage.Ce plateau technique est composé de 4 salles de laboratoire totalement indépendantes pour une superficie utile de 101 m2, et comprend l’ensemble des équipements classiques en biologie moléculaire. Récemment, l’acquisition de deux cryo-réservoirs « secs » à azote a permis de sécuriser le transport ainsi que la conservation d’échantillons collectés sur le terrain. Pour le stockage des échantillons, ce plateau a 4 congélateurs -80°C à disposition.
La salle principale de biologie moléculaire comprend 10 postes de travail, 8 thermocycleurs pour l’amplification d’ADN par PCR, 3 centrifugeuses, ainsi qu’un spectrophotomètre Nanodrop ND1000 et un fluorimètre Qubit2 pour la quantification des acides nucléiques et des protéines. Cette salle comprend également 4 hottes (dont 3 à flux d’air) pour la préparation des échantillons, ainsi que 2 autoclaves Subtil-Crépieux. Un broyeur à billes RETSCH permet l’homogénéisation des tissus avant extraction.
La salle de mix PCR est équipée d’une hotte PCR avec UV pour la préparation des mélanges pré-PCR.
La salle de migration des gels est équipée de 5 cuves à électrophorèse sur gel d’agarose, un système de caméra relié à une plaque UV pour la révélation des gels, et un logiciel d’analyse d’images BIO1D++.
La salle consacrée exclusivement à la préparation et l’analyse des ARN comprend une hotte Captair avec filtre GF4AS, une centrifugeuse eppendorf réfrigérée, ainsi qu’un thermocycleur.
Merci de contacter Lara Konecny et Clémentine Francois si vous souhaitez construire un projet impliquant ce plateau, afin de discuter des méthodes envisageables et de leur faisabilité.
