DEBAECKER Gautier Ingénieur bioinfo
Contract. CNRS : E3S
Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
3, rue Raphaël Dubois - Bât. Darwin C
F-69622 Villeurbanne Cedex France
(+33) 04 72 43 26 03
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Au sein du projet ANR NeGA, j’ai pour rôle d'aider à l'acquisition des données de séquençage, de produire des assemblages, des annotations, et enfin de gérer l'ensemble de ces données. Je travail avec plusieurs laboratoires à Lyon et à Montpellier, ainsi que sur différents modèles biologiques (crustacés, oiseaux, fourmis, papillons, drosophiles).
Mes différentes missions sont :
– La gestion des données produites au sein du projet NeGA (organisation du stockage et de l'accès aux données)
– L’aide à la production des données de séquençage en particulier séquençage ONT (séquençage, basecalling)
– L'assemblage et l’annotation de génomes et de transcriptomes
Within the ANR NeGA project, my role is to help in the acquisition of sequencing data, to produce assemblies, annotations, and finally to manage all these data. I work with several laboratories in Lyon and Montpellier, and on different biological models (crustaceans, birds, ants, butterflies, drosophila).
My different missions are :
- Management of data produced within the NeGA project (organization of storage and access to data)
- Assistance in the production of sequencing data, in particular ONT sequencing (sequencing, basecalling)
- Genome and transcriptome assembly/annotation
