LOBREAU Clément
Master 2 : EVZH
Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
6, rue Raphaël Dubois - Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex FRANCE
(+33) 04 72 43 12 54
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Mon stage s’inscrit dans le cadre d’un programme de recherche mené en collaboration entre le LEHNA (UMR 5023) et le LEM (UMR 5557) sur l’inhibition biologique de la dénitrification (BDI), contrôle biologique du microbiote rhizosphérique (i.e. communauté microbienne lato sensu : procaryotes (bactéries) et eucaryotes (champignons)) via l’inhibition des activités microbiennes. Cette stratégie végétale importante permettant l'acquisition de l'azote et participant ainsi à la croissance des plantes. Il est co-encadré par Florence Piola (LEHNA) et Amélie Cantarel (LEM). Le stage consiste à suivre une expérimentation en mésocomes et à en analyser les résultats. Cette expérimentation vise à comprendre si le BDI est mis en place précocément lors du développement des jeunes plantules du modèle Fallopia issues de la germination des propagules sexuées. En effet, la stratégie BDI a été mise en évidence sur des plantes établies au champ ou en conditions contrôlées sur des plantes régénérées à partir de propagules végétatives (fragments de rhizomes). Bien que la propagation de F. x bohemica ait été longtemps considérée comme clonale, une production de propagules sexuées a été mise en évidence en Europe avec un très grand nombre d’akènes fertiles dispersés chaque année. L’établissement des plantules issues d’akènes pourrait donc reposer sur une mise en place précoce de la stratégie BDI pour l’acquisition de ressources nécessaires aux performances exceptionnelles observées chez Fallopia spp. Les principaux objectifs de ce sujet sont donc : (1) d’analyser si F. x bohemica, connue pour développer une inhibition biologique de la dénitrification (BDI) dans le sol au stade adulte, peut le faire dès la germination, (2) de définir si les conditions de nutrition azotée (qualité et quantité) influencent les traits des plantules et leur capacité à développer une stratégie BDI, et (3) d’étudier la diversité du microbiote des akènes, des racines et de la rhizosphère à des stades de vie précoces ainsi que les assemblages produits et leur impact sur les performances de développement des jeunes plantes. Des mesures d’activités microbiennes, de traits de croissance des plantules et de diversité microbienne (gènes de fonction et métabarcoding) seront menées. Les résultats obtenus seront analyser via des analyses statistiques
multivariées. Un rapport écrit sera produit et un oral de présentation sera préparé.
My internship is part of a collaborative research program between LEHNA (UMR 5023) and LEM (UMR 5557) on the biological inhibition of denitrification (BDI), biological control of the rhizospheric microbiota (i.e. microbial community lato sensu: prokaryotes (bacteria) and eukaryotes (fungi)) via inhibition of microbial activities. This important plant strategy allows the acquisition of nitrogen and thus participates in the growth of plants. It is co-supervised by Florence Piola (LEHNA) and Amélie Cantarel (LEM). The internship consists in following an experiment in mesocomes and in analyzing the results. This experiment aims at understanding if the BDI is implemented early during the development of young Fallopia seedlings resulting from the germination of sexual propagules. Indeed, the BDI strategy has been demonstrated on plants established in the field or under controlled conditions on plants regenerated from vegetative propagules (rhizome fragments). Although the propagation of F. x bohemica has long been considered clonal, a production of sexual propagules has been demonstrated in Europe with a very large number of fertile achenes dispersed each year. The establishment of achene-derived seedlings could therefore rely on an early implementation of the BDI strategy for the acquisition of resources necessary for the exceptional performance observed in Fallopia spp. The main objectives of this topic are therefore: (1) to analyze whether F. x bohemica, known to develop a biological inhibition of denitrification (BDI) in the soil at the adult stage, can do so as soon as germination, (2) to define if the nitrogen nutrition conditions (quality and quantity) influence the traits of the seedlings and their capacity to develop a BDI strategy, and (3) to study the diversity of the microbiota of the achenes, the roots and the rhizosphere at early life stages as well as the assemblages produced and their impact on the developmental performances of the young plants. Measurements of microbial activities, seedling growth traits and microbial diversity (function
genes and metabarcoding) will be
conducted. The results obtained will be analyzed via multivariate
statistical analyses. A written report will be produced and an oral presentation will be prepared.
