MOTTET Flora
Master 2 : BAH
Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
6, rue Raphaël Dubois - Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex FRANCE
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Mon stage de M2 se déroulera dans l’équipe Biodiversité et Adaptation des Hydrosystèmes (BAH) du Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés. Il sera supervisé par Johan Pansu (LEHNA), Mylène Hugoni du laboratoire de Microbiologie, Adaptation et Pathogénie (MAP), Vincent Navratil du laboratoire Plateforme d’Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques (PRABI) et Oldrich Navratil du laboratoire Environnement Ville Société (EVS). L’objectif du projet est d’étudier l’expression des gènes de communautés microbiennes sédimentaires impliqués dans le cycle du carbone. Dans l’objectif de lever divers verrous analytiques, plusieurs stratégies d’analyse bio-informatiques de données métatranscriptomiques seront utilisées et comparées. Les inférences biologiques obtenues à partir de ces les jeux de données de métatranscriptomiques seront ensuite contrastées avec des données de terrain.
The internship of the second year of my master’s degree will be at the “Biodiversité et Adaptation des Hydrosystèmes” (BAH) team of the LEHNA lab (“Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés”). It will be supervised by Johan Pansu from LEHNA, Mylène Hugoni from the “Microbiologie, Adaptation et Pathogénie” lab (MAP), Vincent Navratil from the “Plateforme d’Analyse et Modélisation des Systèmes Biologiques” lab (PRABI) and Oldrich Navratil from the “Environnement Ville Société” lab (EVS). The aim of the project will be to study the genes’ expression in microbial communities, in sediments samples, involved in the carbon cycle. To solve some analytic problems, different strategies of bioinformatic analyses of metatransciptomic data will be used and compared. Then, biological inferences obtained with these datasets will be contrasted with field data.
