VIDBERG Lou-Anne
Master 2 : P3E
Université Lyon 1
CNRS, UMR 5023 - LEHNA,
Laboratoire d'Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés
Bât. Forel
F-69622 Villeurbanne Cedex FRANCE
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Je vais réaliser mon stage de Master 2 sous la supervision de Gilles Escarguel (équipe P3E), Jean-Michel Olivier (équipe BAH) et Sylvain Dolédec (équipe BAH).
Mon sujet porte sur l’évolution des modalités d’assemblages des communautés dans l’Anthropocène, et en particulier sur le cas des macro-invertébrés et ostéichtyens du Bassin du Rhône. En effet, la façon dont les communautés d’espèces s’assemblent localement pourrait être profondément modifiée par la présence et les activités humaines, l’anthropisation étant susceptible de déplacer durablement les équilibres dynamiques entre processus évolutifs (spéciation et dispersion) et fonctionnels (interaction au sein des niches) impliqués dans l’assemblage des communautés (Hubbell, 2001 ; Gravel et al., 2006 ; Vellend et al., 2014).
Plus spécifiquement, les données d’inventaires datées et géo-référencées issues du programme de restauration hydraulique et écologique du Rhône (présence/absence de familles de macro- invertébrés et d’espèces d’ostéichtyens ; Olivier et al., 2009) permettront, pour chacun des deux groupes analysés : (i) d’une part de mesurer l’évolution des relations entre diversité α, β et γ taxinomiques, phylogénétiques et fonctionnelles (Chao et al., 2014 ; Pool et al., 2014) ; (ii) d’autre part de quantifier le poids relatif des processus d’assemblage par la niche et par la dispersion via l’utilisation de la méthode PER-SIMPER/DNCI (Gibert & Escarguel 2019 ; Vilmi et al., 2021).
Il s’agira ainsi d’évaluer les impacts de différents paramètres abiotiques (e.g.,température et oxygénation de l’eau, débit, connectivité de l’hydrosystème, qualité de l’eau) et biotiques (e.g., taille, capacité de dispersion, longévité, préférence thermique, préférences de courant et de substrat, mode d’alimentation) sur les variations au cours du temps de l’équilibre niche-dispersion dans l’assemblage de ces communautés. En outre, l’évaluation de l’impact de ces paramètres pourra se faire à différentes échelles géographiques, par exemple en contrastant lônes naturelles vs. chenaux artificiels, ou encore amont vs. aval de barrages ou de grandes agglomérations.
Références :
Chao A. et al., 2014. Unifying species diversity, phylogenetic diversity, functional diversity, and related similarity and differentiation measures through Hill numbers. Ann. Rev. Ecol. Evol. Syst. 45, 297-324.
Gibert C., Escarguel G., 2019. PER-SIMPER – a new tool for inferring community assembly processes from taxon occurrences. Global Ecol. Biogeogr. 28, 374-385.
Gravel D. et al., 2006. Reconciling niche and neutrality: the continuum hypothesis. Ecol. Lett. 9, 399-409.
Hubbell S.P., 2001. The unified neutral theory of biodiversity and biogeography. Princeton Univ. Press.
Olivier J-M. et al., 2009. The Rhône River Basin. In: Rivers of Europe, Chpt. 7. Academic Press, London, pp. 247-295.
Pool T.K. et al., 2014. Species contribute differently to the taxonomic, functional, and phylogenetic alpha and beta diversity of freshwater fish communities. Divers. Distrib. 20, 1235-1244.
Vellend M. et al. 2014. Assessing the relative importance of neutral stochasticity in ecological communities. Oikos 123, 1420– 1430.
Vilmi A. et al., 2021. Dispersal–niche continuum index: a new quantitative metric for assessing the relative importance of dispersal versus niche processes in community assembly. Ecography 44, 370-379.
I will be doing my second year Master's internship under the supervision of Gilles Escarguel (P3E team), Jean-Michel Olivier (BAH team) and Sylvain Dolédec (BAH team).
My topic focuses on the evolution of community assembly patterns in the Anthropocene, and in particular the case of macroinvertebrates and osteichthyans in the Rhône Basin. The way in which communities of species assemble locally could be profoundly altered by human presence and activities, as anthropisation is likely to permanently shift the dynamic balance between evolutionary (speciation and dispersal) and functional (interaction within niches) processes involved in community assembly (Hubbell, 2001; Gravel et al., 2006; Vellend et al., 2014).
Specifically, the dated and georeferenced data from the Rhône hydraulic and ecological restoration programme (presence/absence of macroinvertebrate families and osteichthyan species; Olivier et al., 2009) will allow, for each of the two groups analysed: (i) to measure changes in the relationships between taxonomic, phylogenetic and functional α, β and γ diversity (Chao et al., 2014; Pool et al., 2014); (ii) to quantify the relative strength of niche and dispersal assembly processes using the PER-SIMPER/DNCI method (Gibert & Escarguel 2019; Vilmi et al., 2021).
The aim is to assess the effects of different abiotic (e.g. water temperature and oxygenation, flow rate, connectivity of the hydrological system, water quality) and biotic parameters (e.g. size, dispersal capacity, longevity, thermal preference, current and substrate preferences, feeding mode) on temporal variations in the niche-dispersion equilibrium within these communities. In addition, the effects of these parameters could be assessed at different geographical scales, such as contrasting natural versus artificial channels, or zones upstream versus downstream of dams or large urban areas.
References :
Chao A. et al., 2014. Unifying species diversity, phylogenetic diversity, functional diversity, and related similarity and differentiation measures through Hill numbers. Ann. Rev. Ecol. Evol. Syst. 45, 297-324.
Gibert C., Escarguel G., 2019. PER-SIMPER – a new tool for inferring community assembly processes from taxon occurrences. Global Ecol. Biogeogr. 28, 374-385.
Gravel D. et al., 2006. Reconciling niche and neutrality: the continuum hypothesis. Ecol. Lett. 9, 399-409.
Hubbell S.P., 2001. The unified neutral theory of biodiversity and biogeography. Princeton Univ. Press.
Olivier J-M. et al., 2009. The Rhône River Basin. In: Rivers of Europe, Chpt. 7. Academic Press, London, pp. 247-295.
Pool T.K. et al., 2014. Species contribute differently to the taxonomic, functional, and phylogenetic alpha and beta diversity of freshwater fish communities. Divers. Distrib. 20, 1235-1244.
Vellend M. et al. 2014. Assessing the relative importance of neutral stochasticity in ecological communities. Oikos 123, 1420– 1430.
Vilmi A. et al., 2021. Dispersal–niche continuum index: a new quantitative metric for assessing the relative importance of dispersal versus niche processes in community assembly. Ecography 44, 370-379.
