Soutenance de la thèse de Nathanaëlle SACLIER
Jeudi 12 décembre à 9h en salle Rhône de l'Irstea (Irstea, Centre de Lyon-Villeurbanne, rue de la Doua, Villeurbanne).
« Origine des variations de taux d’évolution moléculaire inter-spécifiques : apport d’un modèle génomique en milieu souterrain »
Résumé
La vitesse à laquelle les séquences d’ADN évoluent varie selon les espèces. Ces différences peuvent venir de caractéristiques intrinsèques de l’espèce (taux métabolique, traits d’histoire de vie) ou de son environnement (rayonnements ionisants). L’objectif de cette thèse est de tester les hypothèses expliquant les variations de taux d’évolution moléculaire entre les espèces. Pour cela, les particularités des Asellidae souterrains ont été couplées avec des données de séquençage nouvelle génération dans le génome nucléaire et le génome mitochondrial. L’utilisation des Asellidae comme modèle biologique nous permet d’avoir, au sein du même groupe, des espèces ayant indépendamment effectuées une transition vers le milieu souterrain. Cette transition étant accompagnée de nombreux changements, tant biologiques (longévité, taux métabolique, temps de génération) qu’environnementaux, elle nous permet, au sein du même groupe, de pouvoir comparer des espèces contrastées en termes de longévité, de rayonnements ionisants ou encore de productivité et de température. Ce modèle biologique nous permet ainsi de préciser et de quantifier les facteurs responsables de variations du taux d’évolution moléculaire entre les espèces. Par cette approche, un effet du temps de génération sur le taux d’évolution du génome nucléaire et une absence d’effet sur le génome mitochondrial a pu être mis en évidence. Nous avons ensuite montré un effet de la radioactivité naturelle, d’une ampleur analogue à celle du temps de génération, mais cette fois dans les deux compartiments génomiques. Enfin, l’étude des variations des taux d’évolution moléculaire à une échelle globale a révélé des biais dans les calculs des taux de substitutions qui devront être pris en compte dans les études cherchant a établir le lien entre le taux de mutations et la diversification.
« Origine des variations de taux d’évolution moléculaire inter-spécifiques : apport d’un modèle génomique en milieu souterrain »
Résumé
La vitesse à laquelle les séquences d’ADN évoluent varie selon les espèces. Ces différences peuvent venir de caractéristiques intrinsèques de l’espèce (taux métabolique, traits d’histoire de vie) ou de son environnement (rayonnements ionisants). L’objectif de cette thèse est de tester les hypothèses expliquant les variations de taux d’évolution moléculaire entre les espèces. Pour cela, les particularités des Asellidae souterrains ont été couplées avec des données de séquençage nouvelle génération dans le génome nucléaire et le génome mitochondrial. L’utilisation des Asellidae comme modèle biologique nous permet d’avoir, au sein du même groupe, des espèces ayant indépendamment effectuées une transition vers le milieu souterrain. Cette transition étant accompagnée de nombreux changements, tant biologiques (longévité, taux métabolique, temps de génération) qu’environnementaux, elle nous permet, au sein du même groupe, de pouvoir comparer des espèces contrastées en termes de longévité, de rayonnements ionisants ou encore de productivité et de température. Ce modèle biologique nous permet ainsi de préciser et de quantifier les facteurs responsables de variations du taux d’évolution moléculaire entre les espèces. Par cette approche, un effet du temps de génération sur le taux d’évolution du génome nucléaire et une absence d’effet sur le génome mitochondrial a pu être mis en évidence. Nous avons ensuite montré un effet de la radioactivité naturelle, d’une ampleur analogue à celle du temps de génération, mais cette fois dans les deux compartiments génomiques. Enfin, l’étude des variations des taux d’évolution moléculaire à une échelle globale a révélé des biais dans les calculs des taux de substitutions qui devront être pris en compte dans les études cherchant a établir le lien entre le taux de mutations et la diversification.
